More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1467 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  100 
 
 		 268 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  56.34 
 
 		 268 aa  297  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  52.61 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  53.99 
 
 		 268 aa  285  5e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  48.85 
 
 		 263 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  47.92 
 
 		 277 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  45.19 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  37.88 
 
 		 272 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  32.48 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  35.51 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  35.51 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  34.75 
 
 		 334 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  32.95 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  32.12 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  35.97 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  33.57 
 
 		 324 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  34.77 
 
 		 302 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  32.14 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  32.86 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  35.09 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  33.33 
 
 		 280 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  30.94 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  32.74 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  32.37 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  34.51 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  35.97 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  32.98 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  31.9 
 
 		 310 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  32.14 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  32.74 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  33.94 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  34.63 
 
 		 329 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  34.63 
 
 		 324 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  31.56 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  32.62 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  32.98 
 
 		 289 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  32.86 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  30 
 
 		 297 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  33.22 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  29.93 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  33.93 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  32.49 
 
 		 317 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  31.34 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  30.32 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  31.88 
 
 		 290 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  33.58 
 
 		 287 aa  128  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  31 
 
 		 272 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  57.58 
 
 		 110 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  33.58 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  32.99 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  29.3 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  30.07 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  26.77 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  26.77 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  30.68 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  30.11 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  31.79 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  31.79 
 
 		 282 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  31.32 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  29.39 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  29.03 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  31.79 
 
 		 300 aa  121  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  31.36 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  30.5 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  29.43 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  28.99 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  31.9 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  31.18 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  31.07 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  32.63 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  32.01 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  32.26 
 
 		 302 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  31.27 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  28.62 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  31.29 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  32.14 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  29.62 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  32.03 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  32.03 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  32.03 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  30.96 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  31.79 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  31.94 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  31.96 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  31.43 
 
 		 282 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  31.43 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  28.73 
 
 		 282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  29.89 
 
 		 282 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  30.18 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  28.92 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  30.91 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  29.35 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  29.96 
 
 		 331 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  31.88 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  32.21 
 
 		 918 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  30.88 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  30.11 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  28.78 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  31.65 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  28.99 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>