53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1435 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  100 
 
 
202 aa  403  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  58.82 
 
 
201 aa  229  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  42.31 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  39.22 
 
 
215 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  35.89 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  38.61 
 
 
190 aa  118  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  39.71 
 
 
195 aa  118  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  41.9 
 
 
190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  38.1 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  35.07 
 
 
222 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  39.27 
 
 
202 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  35.34 
 
 
227 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  35.82 
 
 
183 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  31.46 
 
 
229 aa  98.2  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  31.3 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  34.72 
 
 
194 aa  94.7  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  31.34 
 
 
227 aa  92  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  31.75 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  36.21 
 
 
196 aa  89.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  30.69 
 
 
234 aa  89  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  29.23 
 
 
209 aa  88.2  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  32.34 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  33.9 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  29.95 
 
 
222 aa  84.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  32.24 
 
 
249 aa  79  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  25.96 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  31.61 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  33.33 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  28.11 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  28 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  29.27 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  28.72 
 
 
359 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  31.33 
 
 
181 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  33.33 
 
 
340 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  30.43 
 
 
181 aa  55.8  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  31.74 
 
 
373 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  29.85 
 
 
263 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  28.47 
 
 
357 aa  48.5  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  31.01 
 
 
266 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  26.63 
 
 
373 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_002978  WD1063  surface antigen Wsp  34.56 
 
 
237 aa  46.6  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00212087  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  30.77 
 
 
280 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  30.53 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  26.74 
 
 
213 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  31.2 
 
 
283 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_002978  WD0501  surface antigen-related protein  28.57 
 
 
293 aa  44.7  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  28.02 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0769  hypothetical protein  27.89 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0798  hypothetical protein  27.21 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  32.58 
 
 
212 aa  42  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1818  hypothetical protein  29.01 
 
 
257 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775304  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0901  surface antigen msp4  32.14 
 
 
289 aa  42  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  23.46 
 
 
213 aa  41.6  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>