More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1430 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  100 
 
 		 812 aa  1676    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  65.35 
 
 		 811 aa  1108    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  50 
 
 		 810 aa  825    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  52.84 
 
 		 815 aa  890    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  55.89 
 
 		 810 aa  924    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  54.93 
 
 		 812 aa  907    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  55.25 
 
 		 810 aa  939    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  40.78 
 
 		 828 aa  542  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  38.03 
 
 		 802 aa  533  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  36.45 
 
 		 802 aa  511  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  36.45 
 
 		 802 aa  511  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  36.05 
 
 		 801 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  37.71 
 
 		 801 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  43.3 
 
 		 738 aa  505  1e-141  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  36.18 
 
 		 801 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  36.59 
 
 		 809 aa  504  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  35.98 
 
 		 801 aa  500  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  35.93 
 
 		 801 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  35.93 
 
 		 801 aa  499  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  35.93 
 
 		 801 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  35.93 
 
 		 801 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  36.69 
 
 		 804 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  35.93 
 
 		 801 aa  502  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  47.32 
 
 		 781 aa  500  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  35.93 
 
 		 801 aa  498  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  35.81 
 
 		 801 aa  498  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  40.28 
 
 		 732 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  36.59 
 
 		 798 aa  488  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  35.29 
 
 		 801 aa  485  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  33.13 
 
 		 815 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  37.6 
 
 		 798 aa  484  1e-135  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  34.99 
 
 		 818 aa  482  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  37.38 
 
 		 796 aa  482  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  36.08 
 
 		 803 aa  480  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  44.69 
 
 		 803 aa  476  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  36.82 
 
 		 813 aa  472  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  36.95 
 
 		 824 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  41.65 
 
 		 745 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  40.03 
 
 		 745 aa  462  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  40.81 
 
 		 732 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  36.88 
 
 		 815 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  35.52 
 
 		 815 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  39.52 
 
 		 747 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  34.38 
 
 		 831 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  35.13 
 
 		 858 aa  453  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  40.29 
 
 		 732 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  35.29 
 
 		 835 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  35.92 
 
 		 815 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  41.08 
 
 		 715 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  42.23 
 
 		 758 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  35.82 
 
 		 815 aa  444  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  41.77 
 
 		 724 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  34.39 
 
 		 790 aa  445  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  34.01 
 
 		 746 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  37.48 
 
 		 815 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  41.27 
 
 		 775 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  38.63 
 
 		 749 aa  435  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  38.44 
 
 		 786 aa  435  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  35.98 
 
 		 825 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  35.55 
 
 		 752 aa  435  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  39.76 
 
 		 735 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  42.73 
 
 		 752 aa  436  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  33.03 
 
 		 815 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  34.63 
 
 		 815 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  33.08 
 
 		 804 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  41.38 
 
 		 679 aa  430  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  41.77 
 
 		 849 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  40.28 
 
 		 780 aa  426  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2035  transcriptional regulator, TrmB  31.72 
 
 		 817 aa  427  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  39.93 
 
 		 751 aa  426  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  35.45 
 
 		 754 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  31.75 
 
 		 832 aa  420  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  36.21 
 
 		 868 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  39.67 
 
 		 661 aa  421  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  41.16 
 
 		 848 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  35.14 
 
 		 744 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  34.19 
 
 		 835 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  37.68 
 
 		 730 aa  417  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  40.73 
 
 		 731 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  40.73 
 
 		 731 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  40.65 
 
 		 914 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  42.31 
 
 		 735 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  34.95 
 
 		 843 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  36.11 
 
 		 866 aa  415  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  39.15 
 
 		 743 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  38.3 
 
 		 739 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  40.21 
 
 		 731 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  40.68 
 
 		 736 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  41.46 
 
 		 821 aa  412  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  41.28 
 
 		 836 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  37.64 
 
 		 770 aa  412  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  34.41 
 
 		 802 aa  412  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  42.41 
 
 		 739 aa  412  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  39.9 
 
 		 732 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  39.76 
 
 		 732 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  39.9 
 
 		 732 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  39.9 
 
 		 732 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  41.28 
 
 		 732 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  39.9 
 
 		 732 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  33.94 
 
 		 829 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>