256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1421 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



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Replicon accession

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Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 
358 aa  743    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.8 
 
 
396 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.18 
 
 
381 aa  299  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  43.54 
 
 
420 aa  295  6e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.75 
 
 
413 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  44.73 
 
 
375 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.73 
 
 
415 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.63 
 
 
427 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  41.9 
 
 
412 aa  289  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.303353 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  43.42 
 
 
416 aa  289  6e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.73 
 
 
415 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.05 
 
 
403 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  42.42 
 
 
416 aa  287  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  41.46 
 
 
414 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.34 
 
 
419 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.06 
 
 
413 aa  276  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.13 
 
 
436 aa  275  6e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  42.58 
 
 
473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.22 
 
 
427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  42.42 
 
 
473 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  42.42 
 
 
473 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  42.42 
 
 
473 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  42.42 
 
 
473 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  42.42 
 
 
473 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  42.58 
 
 
473 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  42.42 
 
 
473 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  42.42 
 
 
473 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.3 
 
 
472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.27 
 
 
393 aa  272  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.31 
 
 
423 aa  271  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.29 
 
 
472 aa  269  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.31 
 
 
422 aa  269  7e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.11 
 
 
460 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.98 
 
 
407 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.6 
 
 
406 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.71 
 
 
408 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.06 
 
 
454 aa  266  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  41.39 
 
 
454 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  40.4 
 
 
415 aa  262  6e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  42.58 
 
 
730 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  42.7 
 
 
453 aa  258  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.37 
 
 
433 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  42.3 
 
 
708 aa  258  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.39 
 
 
419 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.36 
 
 
433 aa  257  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  42.3 
 
 
730 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  39.6 
 
 
527 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.78 
 
 
437 aa  255  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  40.11 
 
 
483 aa  255  8e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  39.22 
 
 
439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.64 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  40.06 
 
 
439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.18 
 
 
420 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  38.38 
 
 
439 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.62 
 
 
437 aa  249  4e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  39.94 
 
 
438 aa  249  4e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.39 
 
 
440 aa  249  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  40.11 
 
 
422 aa  249  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  41.36 
 
 
433 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.94 
 
 
422 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  40.5 
 
 
457 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.84 
 
 
385 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.9 
 
 
437 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.48 
 
 
365 aa  245  8e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.91 
 
 
402 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.11 
 
 
440 aa  242  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  38.55 
 
 
435 aa  242  9e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.64 
 
 
402 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.38 
 
 
374 aa  241  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  37.36 
 
 
402 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.55 
 
 
437 aa  239  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.34 
 
 
432 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.55 
 
 
437 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.12 
 
 
344 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.5 
 
 
411 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  39.22 
 
 
353 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.27 
 
 
347 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.81 
 
 
344 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  37.43 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.17 
 
 
346 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  37.68 
 
 
344 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1818  lysine 2,3-aminomutase  40.51 
 
 
397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.17 
 
 
341 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  36.75 
 
 
407 aa  209  8e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.22 
 
 
347 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  35.26 
 
 
393 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.42 
 
 
353 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  36.5 
 
 
363 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.54 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.04 
 
 
363 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.89 
 
 
345 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  36.61 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.71 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
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NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.98 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.29 
 
 
347 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.525407 
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  38.64 
 
 
366 aa  196  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  33.15 
 
 
340 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.03 
 
 
353 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  38.77 
 
 
360 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.288086 
 
 
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NC_009486  Tpet_0803  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.19 
 
 
365 aa  192  7e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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