More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1396 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 447 aa  920    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  28.76 
 
 		 447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  32.07 
 
 		 486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  31.84 
 
 		 477 aa  188  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  32.18 
 
 		 468 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  33.25 
 
 		 483 aa  178  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  29.76 
 
 		 454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  29.76 
 
 		 454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  30.07 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  30.07 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  30.75 
 
 		 434 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  31.27 
 
 		 429 aa  150  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  31.59 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  29.8 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  29.73 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 446 aa  142  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  28.69 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 400 aa  140  7e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  30.22 
 
 		 445 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 394 aa  136  8e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  28.46 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 		 454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  30.48 
 
 		 339 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 510 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  29.09 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  29 
 
 		 432 aa  123  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  27.51 
 
 		 446 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  23.17 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  30.19 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  29.97 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  29.13 
 
 		 329 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  27.29 
 
 		 474 aa  99.8  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 442 aa  93.2  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  25.62 
 
 		 438 aa  90.1  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  22.63 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  24.72 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  26.08 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 		 460 aa  79.7  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 381 aa  79.7  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  24.85 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  25.8 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  22.22 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  22.95 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  22.95 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  22.29 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  22.29 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  22.29 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  22.58 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  22.34 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  23.9 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 728 aa  75.5  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  23.72 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  24.22 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  23.48 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  24.01 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  25.07 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.59 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.32 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.73 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.73 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.44 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.32 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  21.72 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.32 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0797  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0675001  decreased coverage  0.00122628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  25.4 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>