178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1333 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  100 
 
 
148 aa  298  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1072  arginine repressor, ArgR  68.28 
 
 
148 aa  201  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1249  arginine repressor, ArgR  66.22 
 
 
148 aa  200  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  60 
 
 
148 aa  192  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1324  ArgR family transcriptional regulator  60.81 
 
 
149 aa  188  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1045  arginine repressor  56.08 
 
 
148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.775166 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  58.11 
 
 
148 aa  180  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  38.51 
 
 
152 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  40 
 
 
150 aa  102  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  39.44 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  38.62 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  38.46 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  39.42 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  39.42 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  39.42 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  39.42 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  39.42 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  39.42 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  39.42 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  39.42 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  39.42 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  40.16 
 
 
153 aa  94  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  37.67 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  39.42 
 
 
149 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  35.57 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  39.58 
 
 
177 aa  89.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
151 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  38.89 
 
 
185 aa  88.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  36.64 
 
 
150 aa  87  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  37.93 
 
 
177 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  35.51 
 
 
178 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  38.35 
 
 
184 aa  85.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  38.73 
 
 
167 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
161 aa  84  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  40.16 
 
 
150 aa  84  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  41.35 
 
 
176 aa  84  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  40.15 
 
 
161 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  37.4 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  36.36 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  36.36 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  32.69 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  39.39 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  35.88 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  35.88 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04740  arginine repressor  37.58 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.159421 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0165  arginine repressor  35.71 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  39.01 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  35.38 
 
 
150 aa  80.1  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0161  arginine repressor  35 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  37.14 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  39.42 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  35.06 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  35.29 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  37.23 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  36.23 
 
 
172 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  38.17 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  38.13 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  36.43 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  37.86 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  39.13 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  38.17 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  32.87 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  36.81 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  36.17 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  31.51 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  36.43 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  37.14 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  38.93 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  37.23 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  37.23 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  37.23 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0951  arginine repressor  33.57 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.262992  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  36.11 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  36.11 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  35.17 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02280  arginine repressor  34.69 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
234 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3220  arginine repressor  32.87 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0168204  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  36.55 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2070  arginine repressor  35 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.625599  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3340  arginine repressor  32.87 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0613  arginine repressor  32.87 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3510  arginine repressor  32.87 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.609828  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3628  arginine repressor  32.87 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0608  arginine repressor  32.87 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3686  arginine repressor  32.87 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0849  arginine repressor  32.87 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  35.34 
 
 
189 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3810  arginine repressor  32.87 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.871156  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0769  arginine repressor  32.87 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  35.56 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  32.26 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4899  arginine repressor  34.72 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0419  arginine repressor  34.72 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  36.88 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  38.73 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  37.14 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>