More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1332 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  89 
 
 
401 aa  747    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  84.63 
 
 
400 aa  709    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0777  argininosuccinate synthase  83.38 
 
 
399 aa  709    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  84.13 
 
 
400 aa  705    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  100 
 
 
402 aa  831    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1250  argininosuccinate synthase  84.13 
 
 
400 aa  705    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  85.14 
 
 
400 aa  710    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  56.36 
 
 
413 aa  477  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1071  argininosuccinate synthase  53.55 
 
 
406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000103773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  54.76 
 
 
408 aa  445  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_002936  DET1260  argininosuccinate synthase  53.05 
 
 
406 aa  443  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000184052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0760  argininosuccinate synthase  55.11 
 
 
406 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1043  argininosuccinate synthase  53.55 
 
 
406 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000173868  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0485  argininosuccinate synthase  52.62 
 
 
402 aa  440  9.999999999999999e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  54.9 
 
 
401 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2703  argininosuccinate synthase  54.73 
 
 
402 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0964869  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  53.09 
 
 
401 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  53.35 
 
 
1496 aa  435  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  52.69 
 
 
410 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4765  argininosuccinate synthase  53.48 
 
 
401 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4364  argininosuccinate synthase  53.48 
 
 
401 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4375  argininosuccinate synthase  53.48 
 
 
401 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00862075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  49.88 
 
 
407 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4764  argininosuccinate synthase  53.48 
 
 
401 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000272257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4748  argininosuccinate synthase  53.48 
 
 
401 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4528  argininosuccinate synthase  53.48 
 
 
401 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4880  argininosuccinate synthase  53.48 
 
 
401 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4460  argininosuccinate synthase  52.99 
 
 
401 aa  428  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000068553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4738  argininosuccinate synthase  53.23 
 
 
401 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000528146  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2339  argininosuccinate synthase  51.12 
 
 
464 aa  429  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1228  argininosuccinate synthase  53.63 
 
 
420 aa  428  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.888538  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  51.89 
 
 
399 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0923  argininosuccinate synthase  51.15 
 
 
404 aa  428  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.909799  hitchhiker  0.00000000000000121809 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0753  argininosuccinate synthase  52.01 
 
 
410 aa  427  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000488823  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1792  argininosuccinate synthase  52.9 
 
 
399 aa  427  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0665468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  52.19 
 
 
401 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  50.39 
 
 
402 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0497  argininosuccinate synthase  52.74 
 
 
401 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0549  argininosuccinate synthase  52.59 
 
 
401 aa  423  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0980  argininosuccinate synthase  52.85 
 
 
401 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0566774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0961  argininosuccinate synthase  52.85 
 
 
401 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00623477  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  51.42 
 
 
399 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3306  argininosuccinate synthase  52.24 
 
 
401 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000321819  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2308  argininosuccinate synthase  51.99 
 
 
403 aa  421  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1335  argininosuccinate synthase  51.62 
 
 
399 aa  424  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2882  argininosuccinate synthase  53.03 
 
 
409 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110142  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0882  argininosuccinate synthase  52.55 
 
 
400 aa  422  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887971  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
404 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0556  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
405 aa  418  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1848  argininosuccinate synthase  52.41 
 
 
401 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0125  argininosuccinate synthase  51.39 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132712  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2679  argininosuccinate synthase  52.51 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26590  argininosuccinate synthase  49.62 
 
 
404 aa  417  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  48.88 
 
 
405 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0532  argininosuccinate synthase  49.5 
 
 
405 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30091  argininosuccinate synthase  52.66 
 
 
401 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2068  argininosuccinate synthase  51.39 
 
 
400 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126531  normal  0.0446065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1787  argininosuccinate synthase  52.58 
 
 
397 aa  414  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  49.23 
 
 
403 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0009  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 
400 aa  411  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359968  normal  0.0603517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0369  argininosuccinate synthase  50.89 
 
 
401 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  49.63 
 
 
407 aa  411  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4888  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
399 aa  406  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18441  argininosuccinate synthase  50.87 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.493222 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0731  argininosuccinate synthase  53.05 
 
 
410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4448  argininosuccinate synthase  50.63 
 
 
399 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.450242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4385  argininosuccinate synthase  50.63 
 
 
399 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  49.38 
 
 
403 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  49.11 
 
 
405 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  48.06 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  48.6 
 
 
403 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  47.52 
 
 
407 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0125  argininosuccinate synthase  51.13 
 
 
397 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.035307  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1317  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
400 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.241417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3169  argininosuccinate synthase  49.49 
 
 
400 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0199881 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21901  argininosuccinate synthase  50.38 
 
 
400 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.898377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1743  argininosuccinate synthase  49.49 
 
 
400 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0939  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 
406 aa  397  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0262838  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18981  argininosuccinate synthase  47.86 
 
 
404 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218305  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  48.46 
 
 
411 aa  393  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1659  argininosuccinate synthase  48.12 
 
 
398 aa  392  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.131468  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  47.47 
 
 
397 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0683  argininosuccinate synthase  48.45 
 
 
403 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  46.72 
 
 
397 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  47.19 
 
 
396 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2270  argininosuccinate synthase  48.46 
 
 
399 aa  388  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19171  argininosuccinate synthase  46.5 
 
 
404 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.320605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  46.34 
 
 
399 aa  388  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  46.58 
 
 
406 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21680  argininosuccinate synthase  49.1 
 
 
412 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2981  argininosuccinate synthase  49.48 
 
 
400 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0553526 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2966  argininosuccinate synthase  49.22 
 
 
400 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1459  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 
408 aa  391  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3010  argininosuccinate synthase  49.22 
 
 
400 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62133  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3308  argininosuccinate synthase  50.39 
 
 
400 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.250337  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  45.75 
 
 
406 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  46.91 
 
 
407 aa  388  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2835  argininosuccinate synthase  48.5 
 
 
399 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.480011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  45.5 
 
 
406 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  45.16 
 
 
408 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>