20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1261 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1261  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  205  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000635316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2675  hypothetical protein  55.79 
 
 
100 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0677019  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0290  hypothetical protein  50.56 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2515  hypothetical protein  49.44 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.752602  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0688  hypothetical protein  48.86 
 
 
90 aa  86.3  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3293  hypothetical protein  48.86 
 
 
90 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.511705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0563  hypothetical protein  49.41 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0946  hypothetical protein  49.38 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2752  hypothetical protein  42.86 
 
 
98 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2875  hypothetical protein  44.19 
 
 
112 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000535369 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2182  hypothetical protein  47.62 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0140111  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2184  hypothetical protein  45.24 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2199  hypothetical protein  46.43 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1925  hypothetical protein  40 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.577323  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0521  hypothetical protein  40.24 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2011  CopG/DNA-binding domain-containing protein  40 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226178  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0548  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1840  hypothetical protein  35.19 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1800  hypothetical protein  35.19 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1787  hypothetical protein  35.19 
 
 
85 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>