More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1241 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 412 aa  824    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  46.38 
 
 		 393 aa  332  9e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  39.38 
 
 		 432 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  38.8 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  38.13 
 
 		 420 aa  230  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  37.9 
 
 		 408 aa  226  7e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  33.64 
 
 		 447 aa  177  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  31.34 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  32.3 
 
 		 408 aa  166  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  30.04 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  28.78 
 
 		 442 aa  153  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  30.11 
 
 		 447 aa  146  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  29.95 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  31.19 
 
 		 401 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  30.94 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.54 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  32.11 
 
 		 449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  35.37 
 
 		 332 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.4 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  33.81 
 
 		 336 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  33.81 
 
 		 336 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  32.89 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30.56 
 
 		 862 aa  103  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  44.94 
 
 		 286 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  42.11 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  30.43 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  32.34 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  41.21 
 
 		 291 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  51.41 
 
 		 277 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  29.62 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  44.06 
 
 		 291 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  28.99 
 
 		 448 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  33.13 
 
 		 343 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  28.74 
 
 		 870 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  31.99 
 
 		 576 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  32.8 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  37.2 
 
 		 441 aa  97.4  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  33.13 
 
 		 343 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  30.29 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  30.29 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  41.71 
 
 		 243 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  39.88 
 
 		 279 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  39.88 
 
 		 279 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  46.72 
 
 		 745 aa  95.5  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  41.57 
 
 		 204 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  31.03 
 
 		 1191 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  40.12 
 
 		 189 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  39.51 
 
 		 266 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  28.77 
 
 		 483 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  30.7 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  33.03 
 
 		 311 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  28.49 
 
 		 389 aa  94.4  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  45.95 
 
 		 278 aa  94  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  31.6 
 
 		 319 aa  93.2  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  27.92 
 
 		 420 aa  92.8  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  46.97 
 
 		 190 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  44.52 
 
 		 184 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  38.82 
 
 		 260 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  43.05 
 
 		 184 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  37.79 
 
 		 264 aa  92.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  42.75 
 
 		 776 aa  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  38.3 
 
 		 273 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  41.04 
 
 		 225 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  38.61 
 
 		 199 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  43.14 
 
 		 234 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  35.09 
 
 		 206 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  42.2 
 
 		 213 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  37.29 
 
 		 218 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  38.75 
 
 		 331 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  41.77 
 
 		 241 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  38.42 
 
 		 214 aa  89.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  42.41 
 
 		 567 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  41.06 
 
 		 320 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  38.12 
 
 		 199 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  34.07 
 
 		 268 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  39.2 
 
 		 489 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  28.91 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  40.62 
 
 		 903 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  41.42 
 
 		 203 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  42.01 
 
 		 299 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  44.53 
 
 		 521 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  28.83 
 
 		 433 aa  87.4  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  29.29 
 
 		 295 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  40.31 
 
 		 266 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  40.88 
 
 		 213 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  44 
 
 		 900 aa  86.7  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  30.9 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  45.07 
 
 		 216 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  40.88 
 
 		 517 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  41.26 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  28.08 
 
 		 881 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  22.32 
 
 		 607 aa  85.5  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  35.96 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  36.57 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  47.48 
 
 		 1033 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  36.31 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  24.85 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.51 
 
 		 525 aa  84  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  41.1 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  28.5 
 
 		 493 aa  83.2  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>