More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1198 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  74.51 
 
 		 154 aa  245  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  64.94 
 
 		 212 aa  207  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  59.21 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  53.9 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.81 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  36.55 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.66 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  35.86 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.93 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  36.55 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  36.55 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 153 aa  94  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.72 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.43 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.43 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  34.19 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.45 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  33.1 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  31.69 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  34.42 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  34.25 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  29.61 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  33.09 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  31.08 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  30.94 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  26.62 
 
 		 276 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  32.87 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  26.85 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  33.56 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.54 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.76 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  34.06 
 
 		 282 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  32.14 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26.49 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  29.86 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  31.82 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.77 
 
 		 304 aa  71.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3248  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  30.28 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  29.93 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  28.19 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  29.17 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.56 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  29.8 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  29.88 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.11 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32.12 
 
 		 307 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  29.41 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  30.46 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  32.03 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  32.19 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  29.17 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  28.06 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3329  UspA domain-containing protein  24.34 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  28.95 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  29.45 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1043  UspA domain-containing protein  24.34 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1010  UspA domain-containing protein  24.34 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  30.32 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  30.49 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1031  UspA domain protein  25.17 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.365908 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>