More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1177 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
262 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  68.46 
 
 
261 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  67.82 
 
 
273 aa  362  4e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  64.86 
 
 
262 aa  340  1e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  62.31 
 
 
269 aa  331  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  62.55 
 
 
263 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  59.22 
 
 
263 aa  305  6e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  47.2 
 
 
266 aa  211  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 
285 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  44.02 
 
 
268 aa  185  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  40.91 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  40.38 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  40.8 
 
 
297 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  40.8 
 
 
297 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  39.69 
 
 
271 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 
267 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  41 
 
 
287 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  40.67 
 
 
275 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  38.74 
 
 
291 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  40.32 
 
 
282 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 
293 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  40.39 
 
 
274 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  38.34 
 
 
272 aa  175  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  40.89 
 
 
276 aa  175  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 
268 aa  175  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  39.68 
 
 
262 aa  175  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  39.62 
 
 
281 aa  175  8e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  41.87 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  38.98 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  41.09 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  39.08 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  39.1 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  39.44 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  39.25 
 
 
292 aa  173  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  42.26 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4810  dimethyladenosine transferase  38.34 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  0.0271814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  41.11 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  42.26 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  42.26 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  42.26 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  42.26 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  42.26 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  42.26 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  42.26 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  38.91 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 
268 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 
268 aa  172  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  38.72 
 
 
269 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  40.43 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  39.51 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 
268 aa  171  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  37.94 
 
 
280 aa  171  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  41.89 
 
 
292 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  41.89 
 
 
292 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 
268 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  39.69 
 
 
267 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  39.38 
 
 
272 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  39.16 
 
 
278 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  36.02 
 
 
269 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  39.29 
 
 
257 aa  169  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  39.15 
 
 
284 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  39.47 
 
 
288 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  36.96 
 
 
285 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  41 
 
 
294 aa  169  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  41.37 
 
 
267 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 
267 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  41.37 
 
 
268 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  39.47 
 
 
291 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  38.22 
 
 
272 aa  168  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  38.95 
 
 
301 aa  168  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  35.52 
 
 
266 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  36.23 
 
 
272 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  36.9 
 
 
297 aa  167  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
267 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  39.08 
 
 
278 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  36.02 
 
 
267 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 
268 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  41.51 
 
 
260 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  39.06 
 
 
264 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 
268 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  36.02 
 
 
267 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5273  dimethyladenosine transferase  38.25 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  40.91 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  34.87 
 
 
266 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  37.15 
 
 
268 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 
272 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  41.02 
 
 
269 aa  165  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1238  dimethyladenosine transferase  39.59 
 
 
249 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 
305 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  37.11 
 
 
301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
268 aa  165  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  39.16 
 
 
268 aa  165  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  38.55 
 
 
264 aa  165  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  38.75 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  39.08 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  36.25 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>