49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1158 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  100 
 
 
360 aa  751    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  63.91 
 
 
363 aa  508  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  29.93 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  35.62 
 
 
638 aa  79.7  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  33.56 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  32.88 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  32.87 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  30.63 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  30.07 
 
 
650 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  30.5 
 
 
539 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  28.47 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  31.06 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  25.97 
 
 
377 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  27.97 
 
 
617 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  26.99 
 
 
371 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  25.62 
 
 
370 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  29.79 
 
 
375 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  28.21 
 
 
375 aa  60.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  28.21 
 
 
375 aa  60.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  25.77 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  28.99 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  27.34 
 
 
422 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  29.29 
 
 
354 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  27.54 
 
 
366 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  27.15 
 
 
589 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  31.21 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  25.87 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  23.81 
 
 
399 aa  55.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  23.53 
 
 
349 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  26.09 
 
 
365 aa  53.9  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  20.87 
 
 
367 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  25.14 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  23.74 
 
 
458 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  23.11 
 
 
394 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  26.95 
 
 
341 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  26.57 
 
 
320 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  21.28 
 
 
368 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  24.68 
 
 
409 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2745  HNH endonuclease  38.89 
 
 
149 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00704731  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  26.53 
 
 
374 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  22.67 
 
 
377 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1065  hypothetical protein  28.57 
 
 
178 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  38.6 
 
 
189 aa  44.3  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  24 
 
 
174 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  31.18 
 
 
206 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  26.06 
 
 
345 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  34.38 
 
 
560 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  26.76 
 
 
405 aa  43.1  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  32.79 
 
 
375 aa  42.7  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>