More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1144 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 338 aa  691    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  71.3 
 
 		 339 aa  506  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  64.74 
 
 		 346 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  56.36 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  38.71 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  34.16 
 
 		 335 aa  202  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  39.31 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  38.59 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  38.16 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  32.51 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.09 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  34.8 
 
 		 353 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  34.66 
 
 		 336 aa  179  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  36.16 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  31.46 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  36.98 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  33.97 
 
 		 348 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  33.94 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  32.53 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  31.71 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  32.62 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  31.1 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  34.45 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.72 
 
 		 343 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.9 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  32.13 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  31.31 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  30.43 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  31.27 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  32.2 
 
 		 368 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  31.99 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  31.1 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 		 327 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  30.28 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  31.17 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  33.96 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  30.84 
 
 		 323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  30.46 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  32.91 
 
 		 353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  32.58 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  33.45 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  28.53 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  31.8 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  33.67 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  33.1 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  33.94 
 
 		 345 aa  143  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.82 
 
 		 361 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  33.22 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  32.81 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  32.23 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  32.81 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  29.94 
 
 		 350 aa  139  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  33.01 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  32.68 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  28.36 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  31.03 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  31.02 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  30.16 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  32.52 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  30.86 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  29.86 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.51 
 
 		 350 aa  135  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  29.93 
 
 		 340 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  30.92 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  30.94 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.55 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  30.22 
 
 		 362 aa  132  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  32.03 
 
 		 329 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  29.91 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  32.85 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.52 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.7 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  29.91 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.37 
 
 		 349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  30.1 
 
 		 340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  29.91 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  29.91 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  29.91 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  31.34 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000775168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  29.61 
 
 		 323 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  28.92 
 
 		 374 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  30.49 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  29.22 
 
 		 374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.13 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  30.42 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.07 
 
 		 349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  28.61 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  29.39 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  29.5 
 
 		 352 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  32.65 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  30.15 
 
 		 347 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  27.58 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  28.81 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  28.82 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  29.51 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  28.18 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  28.41 
 
 		 417 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  27.99 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.45 
 
 		 367 aa  122  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.49 
 
 		 349 aa  122  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>