More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1121 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  100 
 
 		 303 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  88.41 
 
 		 303 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  83.17 
 
 		 303 aa  534  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  83.06 
 
 		 303 aa  528  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  81.4 
 
 		 303 aa  519  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  79.87 
 
 		 303 aa  519  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  79.73 
 
 		 303 aa  504  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  56.15 
 
 		 306 aa  363  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  54.13 
 
 		 318 aa  358  5e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  53.69 
 
 		 307 aa  355  5e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  55.18 
 
 		 313 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  54.67 
 
 		 305 aa  348  6e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  54.67 
 
 		 305 aa  348  8e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  52.84 
 
 		 305 aa  347  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  53.85 
 
 		 305 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  54.33 
 
 		 305 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  53.67 
 
 		 304 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  52.17 
 
 		 307 aa  338  9e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  52.51 
 
 		 305 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  50.17 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  51.33 
 
 		 308 aa  332  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  52.17 
 
 		 312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  52.33 
 
 		 306 aa  326  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  52.74 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  52.05 
 
 		 313 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  52.4 
 
 		 314 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  49.5 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  51.03 
 
 		 314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  48.54 
 
 		 308 aa  297  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  45.54 
 
 		 304 aa  285  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  45.07 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  41.28 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  40.48 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  29.03 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  28.8 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  27.89 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  25.35 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  28.43 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  27.65 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  26.6 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  24.53 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  24.21 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  25.67 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  23.08 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  24.91 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  26.26 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  22.11 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  26.26 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  24.18 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  28.94 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  24.15 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  23.4 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  24.14 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  25.98 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  25.08 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  25.88 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  27.3 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  23.29 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  24 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  31.08 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  23.4 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  26.69 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  34.13 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  27.06 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  37.5 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  24.14 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  23.7 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  25.95 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  29.22 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  24.32 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  24.32 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.62 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  31.08 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  23.38 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  23.74 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.9 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  24.44 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  31.39 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  35.71 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  31.39 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  33.05 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  23.85 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  33.33 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  25.58 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  25.38 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  31.78 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  27.3 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  32.11 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  25 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  24.47 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  28.89 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.74 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.74 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  30.83 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  30.83 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  25.64 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  32.29 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  30.83 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  30.83 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  30.83 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>