50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1081 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  70.62 
 
 		 215 aa  271  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  55.73 
 
 		 190 aa  207  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  44.5 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  44.62 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  44.04 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  42.62 
 
 		 202 aa  121  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  39.69 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  39.44 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  34.52 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  38.5 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  36.6 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  35.16 
 
 		 222 aa  101  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  39.31 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  35.14 
 
 		 229 aa  97.8  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  34.68 
 
 		 227 aa  93.6  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  39.01 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  35.12 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  31.43 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  33.67 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  32.74 
 
 		 249 aa  84.7  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  32.28 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  32.05 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  33.64 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  32.22 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  30.84 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  30.77 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  30.65 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  30.23 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  34.9 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  34.9 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  31.92 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  28.37 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  32.03 
 
 		 263 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  29.38 
 
 		 409 aa  48.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  27.89 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  27.89 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  28.1 
 
 		 359 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  33.33 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  33.33 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  33.33 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1063  surface antigen Wsp  28.23 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00212087  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  25.95 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  25.95 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  27.9 
 
 		 245 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  30.15 
 
 		 229 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1633  outer surface protein  30.4 
 
 		 274 aa  42.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.498994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1689  outer surface protein  30.4 
 
 		 274 aa  42  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2620  putative heat resistant agglutinin 1 signal peptide protein  27.74 
 
 		 265 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.875915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  27.86 
 
 		 225 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>