More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1030 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  67.03 
 
 
276 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  59.86 
 
 
287 aa  345  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  61.4 
 
 
287 aa  338  4e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  33.92 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  34.47 
 
 
284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  32.12 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
350 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
301 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
287 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
340 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
290 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
340 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
340 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
283 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
295 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
323 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
291 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
291 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
291 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 
350 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.86 
 
 
341 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
314 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  26 
 
 
302 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
261 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  29.26 
 
 
290 aa  99  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
340 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
298 aa  99.4  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 
340 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
340 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 
340 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  28.52 
 
 
291 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 
291 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 
291 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  28.52 
 
 
291 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 
291 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
339 aa  95.5  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  23.38 
 
 
313 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  28.52 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
361 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  29.63 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
333 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
315 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  28.15 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 
312 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 
291 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  28.15 
 
 
291 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
299 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  28.25 
 
 
291 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
292 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
322 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  26.47 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
345 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  22.66 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  24.91 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
290 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  30.15 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
316 aa  89  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
298 aa  89  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
286 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  29.08 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
311 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 
294 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
294 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
294 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
290 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
310 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
287 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
279 aa  87  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
286 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 
260 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 
260 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  26.88 
 
 
462 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  25.56 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
295 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
285 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  27.44 
 
 
462 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
329 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
285 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
285 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.44 
 
 
315 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
299 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.44 
 
 
315 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>