More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1023 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  100 
 
 
467 aa  979    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  70.59 
 
 
461 aa  705    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  75.58 
 
 
471 aa  772    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1617  Radical SAM domain protein  78.63 
 
 
469 aa  774    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  80.18 
 
 
465 aa  789    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  72.04 
 
 
462 aa  714    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  80.77 
 
 
469 aa  808    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  81.37 
 
 
467 aa  827    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  80.43 
 
 
468 aa  804    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  37.08 
 
 
444 aa  256  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  32.94 
 
 
433 aa  237  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 
428 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 
439 aa  221  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  33.66 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  32.62 
 
 
434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  30.87 
 
 
428 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 
426 aa  210  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 
429 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  31.97 
 
 
434 aa  207  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  33.62 
 
 
430 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  29.9 
 
 
441 aa  206  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0267  Radical SAM domain protein  29.24 
 
 
469 aa  200  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626864  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 
468 aa  199  7e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2731  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 
465 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0200  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 
468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0997671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 
448 aa  196  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  29.9 
 
 
462 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1806  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 
468 aa  195  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0407  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.13 
 
 
466 aa  194  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201202  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 
486 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 
433 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 
449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  29.8 
 
 
477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 
444 aa  190  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0116  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.25 
 
 
461 aa  190  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 
446 aa  186  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  30.18 
 
 
471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  29.72 
 
 
459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  29.92 
 
 
471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.76 
 
 
479 aa  184  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 
480 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2757  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 
462 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 
470 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.07 
 
 
471 aa  178  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 
475 aa  176  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 
483 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 
471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  28.9 
 
 
490 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 
445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 
477 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 
474 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  25.06 
 
 
477 aa  159  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.33 
 
 
478 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 
476 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 
471 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 
473 aa  153  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.48 
 
 
441 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 
441 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.26 
 
 
472 aa  150  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 
472 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 
451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3556  Radical SAM domain protein  28.93 
 
 
450 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1164  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 
481 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 
468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1163  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 
444 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 
509 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  25.82 
 
 
532 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0513  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 
445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000241934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3555  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 
448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 
502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  25.26 
 
 
503 aa  120  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3535  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 
600 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  24.69 
 
 
527 aa  118  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0919  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 
422 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 
520 aa  116  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  24.49 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1089  radical SAM family Fe-S protein  27.75 
 
 
591 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.977516  normal  0.0200721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 
583 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 
484 aa  113  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.13 
 
 
609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  24.01 
 
 
533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0513  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 
609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  24.13 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 
542 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 
493 aa  111  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  26.14 
 
 
527 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 
547 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  23.77 
 
 
500 aa  110  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 
503 aa  110  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  26.46 
 
 
580 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0515  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 
603 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  24.69 
 
 
498 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  30.85 
 
 
424 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 
546 aa  107  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 
576 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 
531 aa  106  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 
576 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 
547 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>