131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1018 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 332 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0230  putative PAS/PAC sensor protein  54.68 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0562  putative PAS/PAC sensor protein  52.66 
 
 		 332 aa  318  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  48.91 
 
 		 326 aa  292  6e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  42.12 
 
 		 327 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  39.64 
 
 		 303 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1028  putative PAS/PAC sensor protein  38.89 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1298  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 		 442 aa  166  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 		 554 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0872  histidine kinase  44.55 
 
 		 585 aa  159  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.39 
 
 		 1115 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 		 604 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1413  transcriptional regulator  57.45 
 
 		 112 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.946834  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 705 aa  116  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  60 
 
 		 115 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1431  sigma54 specific transcriptional regulator with PAS/PAC sensor, Fis family  37.75 
 
 		 806 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.333003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 682 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 		 575 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  34.01 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.47 
 
 		 602 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 641 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  47.37 
 
 		 119 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1165  hypothetical protein  51.02 
 
 		 113 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3468  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  52.27 
 
 		 745 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0436703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0328  putative PAS/PAC sensor protein  47.37 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3129  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.52 
 
 		 777 aa  89.7  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.765489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3012  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.43 
 
 		 619 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299906  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1839  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.89 
 
 		 763 aa  83.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.338108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2163  sigma54 specific transcriptional regulator with PAS/PAC sensor, Fis family  43.96 
 
 		 575 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  35.26 
 
 		 589 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 773 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  44.32 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2550  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.64 
 
 		 412 aa  75.9  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665651  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  45.88 
 
 		 99 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2973  hypothetical protein  41.12 
 
 		 137 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2194  histidine kinase  27.5 
 
 		 609 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3395  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.43 
 
 		 834 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  43.66 
 
 		 1251 aa  69.7  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  41.84 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3394  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 560 aa  69.3  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  42.55 
 
 		 120 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  38.89 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 673 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3137  hypothetical protein  42.71 
 
 		 127 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 103 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  36.73 
 
 		 126 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1715  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.37 
 
 		 749 aa  63.9  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2491  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1341 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0803  hypothetical protein  38.46 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  41.56 
 
 		 96 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4430  hypothetical protein  37.21 
 
 		 147 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1117  putative PAS/PAC sensor protein  30.25 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4062  hypothetical protein  37.21 
 
 		 147 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4544  hypothetical protein  38.46 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.234964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  35.35 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  37.21 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1486  hypothetical protein  35.29 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0003803  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.76 
 
 		 853 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  34.09 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  37.36 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  36.59 
 
 		 89 aa  58.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 94 aa  57.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  40.66 
 
 		 100 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  37.66 
 
 		 112 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 785 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0369  putative PAS/PAC sensor protein  29.09 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.406027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3014  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  40 
 
 		 98 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0765911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2484  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.399715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0472  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.76 
 
 		 853 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000400428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 1255 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 99 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  31.46 
 
 		 97 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  34.07 
 
 		 101 aa  53.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  36.36 
 
 		 106 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 110 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 98 aa  52.8  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4890  putative transcriptional regulator  37.66 
 
 		 98 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.040811  normal  0.40753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 964 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 703 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1114  regulatory protein MarR  29.21 
 
 		 102 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0481626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  35.06 
 
 		 104 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 1418 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 99 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 1369 aa  49.7  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 99 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1352  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 101 aa  49.3  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.182081  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2191  regulatory protein, ArsR  28.89 
 
 		 138 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 832 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  33.77 
 
 		 1092 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3774  PAS  47.17 
 
 		 395 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195933  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 104 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2007  putative PAS/PAC sensor protein  32.08 
 
 		 692 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3368  histidine kinase  36.84 
 
 		 434 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.383223  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4596  hypothetical protein  33.75 
 
 		 100 aa  47  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505761  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1021 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>