137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0926 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  100 
 
 		 435 aa  890    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1802  amine oxidase  56.42 
 
 		 439 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000252839  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0884  amine oxidase  54.63 
 
 		 438 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0152  amine oxidase  41.07 
 
 		 439 aa  339  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  25.93 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  24.43 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  29.1 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  20.29 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  23.56 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  21.7 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  38.89 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  44.12 
 
 		 381 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  20.46 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  20.96 
 
 		 488 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  49.06 
 
 		 319 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  22.07 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  49.02 
 
 		 542 aa  53.5  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  22.45 
 
 		 469 aa  53.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  36.62 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  23.59 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0248  protoporphyrinogen oxidase, putative  22.4 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  23.1 
 
 		 523 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  36.36 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  54 
 
 		 548 aa  50.8  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  25.58 
 
 		 459 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  32.14 
 
 		 843 aa  50.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  20.77 
 
 		 509 aa  50.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  35.53 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  36.99 
 
 		 447 aa  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  37.33 
 
 		 503 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  22.45 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  25.25 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1707  amine oxidase  30.28 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0462  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1971  amine oxidase  46.43 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  44.23 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  28.32 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  32.43 
 
 		 499 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  19.83 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  42.31 
 
 		 486 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  32.43 
 
 		 484 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 		 488 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  38.81 
 
 		 480 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  24.35 
 
 		 495 aa  47.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1824  glutamate synthase (NADPH)  28.03 
 
 		 677 aa  47  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  34.72 
 
 		 491 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  22.59 
 
 		 399 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  47.92 
 
 		 313 aa  47.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  30.26 
 
 		 438 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  22.15 
 
 		 419 aa  47  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  38.33 
 
 		 466 aa  47  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  38.33 
 
 		 466 aa  47  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  32.38 
 
 		 469 aa  46.6  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  50 
 
 		 313 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  54.35 
 
 		 570 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  41.82 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  40.38 
 
 		 486 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  20.89 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  20.9 
 
 		 463 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  31.08 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  41.18 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  25 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  31.65 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  46.15 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  42.31 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  42 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 328 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  34.29 
 
 		 502 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  34.29 
 
 		 502 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2058  NAD/FAD-binding protein-like protein  31.3 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00023874  normal  0.0560685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  46.15 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  22.11 
 
 		 485 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  42.59 
 
 		 484 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  41.82 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  19.83 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  45.1 
 
 		 536 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  40.98 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  31.08 
 
 		 484 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  60.53 
 
 		 508 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  21.6 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  21.52 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  44 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  26.35 
 
 		 560 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  22.11 
 
 		 490 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  29.7 
 
 		 437 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  26.06 
 
 		 560 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 		 471 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  21.83 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  42.86 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  25.75 
 
 		 560 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  40.38 
 
 		 467 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  46.51 
 
 		 508 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>