More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0906 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 160 aa  317  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  83.12 
 
 		 160 aa  271  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  80 
 
 		 160 aa  255  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  78.12 
 
 		 176 aa  253  5e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  78.12 
 
 		 159 aa  252  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  78.75 
 
 		 159 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  78.75 
 
 		 159 aa  249  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  55.26 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 176 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  47.37 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 158 aa  134  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  50.33 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  47.1 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  44.94 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  44.94 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  44.94 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  45.75 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  42.86 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  43.04 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  42.31 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  39.35 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  39.87 
 
 		 173 aa  120  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>