119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0859 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0859  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 438 aa  869    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.221691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1578  major facilitator superfamily MFS_1  81.13 
 
 		 438 aa  690    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0877587 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1481  transporter, putative  65.41 
 
 		 441 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1686  major facilitator superfamily MFS_1  68.96 
 
 		 454 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000674894  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1867  major facilitator transporter  65.8 
 
 		 436 aa  561  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1094  major facilitator superfamily MFS_1  65.09 
 
 		 437 aa  557  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.929439  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0889  transporter, putative  64.69 
 
 		 437 aa  554  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1647  hypothetical protein  35.63 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411737  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2269  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57608  predicted protein  24.79 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.371537 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  23.1 
 
 		 642 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01489  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04850)  21.86 
 
 		 533 aa  76.6  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0186505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.49 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 457 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  31.62 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  29.82 
 
 		 471 aa  50.1  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 464 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  30.15 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 454 aa  48.5  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  30.41 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.33 
 
 		 472 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  32.58 
 
 		 462 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 472 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  33.33 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  33.33 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  33.33 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 454 aa  47  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 454 aa  47  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4248  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718043  unclonable  0.0000000000020202 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.27 
 
 		 422 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.899402  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 452 aa  46.6  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1117  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.316307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 		 558 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  37.04 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  25.26 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0368  major facilitator transporter  35 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  30.57 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1788  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  24.73 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  38.37 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.86 
 
 		 587 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 476 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  27.1 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  27.1 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1065 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  33.72 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  23.17 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  33.72 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  33.72 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  33.72 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  33.72 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.13 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.5 
 
 		 534 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0610  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 407 aa  44.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  32.1 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0780  major facilitator family transporter  27.1 
 
 		 490 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114821  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  37.93 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  32.1 
 
 		 478 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19051  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.07 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  32.1 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  32.1 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  32.1 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  33.8 
 
 		 467 aa  43.9  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 394 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>