More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0842 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  61.16 
 
 
537 aa  674    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
537 aa  1094    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  56.03 
 
 
560 aa  609  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  57.31 
 
 
545 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  51.35 
 
 
554 aa  545  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  52.73 
 
 
526 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  50.19 
 
 
519 aa  495  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3257  apolipoprotein N-acyltransferase  29.02 
 
 
533 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  29.98 
 
 
525 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6937  apolipoprotein N-acyltransferase  28.46 
 
 
538 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.207739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12383  Apolipoprotein N-acyltransferase  28.84 
 
 
527 aa  201  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0630157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  29.42 
 
 
521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  30.77 
 
 
506 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0412  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 
539 aa  198  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.107185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  28.46 
 
 
507 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  28.33 
 
 
507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  29.84 
 
 
521 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  28.66 
 
 
477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  31.23 
 
 
529 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  32.04 
 
 
510 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  29.37 
 
 
516 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  26.54 
 
 
513 aa  162  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  31.31 
 
 
514 aa  161  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  25.79 
 
 
532 aa  160  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  27.45 
 
 
542 aa  160  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  31.83 
 
 
505 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  28.86 
 
 
553 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  27.05 
 
 
528 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  29.4 
 
 
506 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2299  apolipoprotein N-acyltransferase  26.02 
 
 
525 aa  140  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  28.33 
 
 
502 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  30.12 
 
 
507 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  24.76 
 
 
544 aa  138  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  26.51 
 
 
526 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  28.13 
 
 
506 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  26.6 
 
 
524 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  29.12 
 
 
497 aa  134  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  26.97 
 
 
524 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2717  apolipoprotein N-acyltransferase  27.82 
 
 
589 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419709  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  29.2 
 
 
504 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0363  apolipoprotein N-acyltransferase  27.61 
 
 
487 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  28.64 
 
 
485 aa  130  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285034  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  30.75 
 
 
528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0678  apolipoprotein N-acyltransferase  29.02 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  29.04 
 
 
479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  27.81 
 
 
505 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  25.68 
 
 
524 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0986  apolipoprotein N-acyltransferase  23.6 
 
 
760 aa  127  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  29.96 
 
 
522 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  27.19 
 
 
489 aa  126  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  29.86 
 
 
504 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2809  apolipoprotein N-acyltransferase  27.19 
 
 
590 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  24.7 
 
 
523 aa  125  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2902  apolipoprotein N-acyltransferase  26.84 
 
 
590 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0345  apolipoprotein N-acyltransferase  27.22 
 
 
487 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  28.38 
 
 
506 aa  124  4e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  27.63 
 
 
505 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  30.09 
 
 
505 aa  124  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  31.6 
 
 
566 aa  123  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  27.27 
 
 
505 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  27.78 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  30.65 
 
 
510 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  28.31 
 
 
508 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  26.16 
 
 
510 aa  123  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  28.31 
 
 
512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  30.63 
 
 
576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  26.9 
 
 
537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  27.68 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  27.45 
 
 
524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  25.6 
 
 
475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  27.78 
 
 
512 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  27.51 
 
 
512 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  27.78 
 
 
512 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  28.04 
 
 
512 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  27.78 
 
 
512 aa  120  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  30.49 
 
 
553 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  27.35 
 
 
505 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  25.87 
 
 
535 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  25.71 
 
 
507 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  26.48 
 
 
520 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  27.51 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  27.36 
 
 
505 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  27.11 
 
 
529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  27.11 
 
 
529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  27.09 
 
 
521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  25.8 
 
 
522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  33.97 
 
 
500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  27.11 
 
 
529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  29.84 
 
 
567 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  27.11 
 
 
529 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  27.63 
 
 
512 aa  118  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  27.11 
 
 
529 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  27.7 
 
 
532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  29.52 
 
 
567 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  28.31 
 
 
509 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  28.29 
 
 
509 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  28.43 
 
 
511 aa  117  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  25.83 
 
 
550 aa  116  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  25.6 
 
 
520 aa  116  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  25.97 
 
 
532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>