More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0818 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  100 
 
 		 447 aa  921    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  56.56 
 
 		 449 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  54.52 
 
 		 445 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  54.73 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  52.57 
 
 		 451 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  49.89 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0591  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  48.75 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  35.49 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  38.03 
 
 		 453 aa  286  7e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  38.88 
 
 		 452 aa  285  9e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  38.98 
 
 		 452 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  39.81 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  37.72 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  35.86 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  40.36 
 
 		 446 aa  260  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  35.92 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  36.55 
 
 		 452 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  35.35 
 
 		 444 aa  256  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  36.24 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  36.02 
 
 		 451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  36.11 
 
 		 468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  35.87 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  36 
 
 		 457 aa  251  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  37.62 
 
 		 451 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  35.63 
 
 		 451 aa  242  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  34.06 
 
 		 462 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  35.7 
 
 		 453 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  37.96 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  34.76 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  36.89 
 
 		 448 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.41 
 
 		 449 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  33.33 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  34.53 
 
 		 446 aa  229  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  33.11 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  35.94 
 
 		 452 aa  222  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  33.7 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  34.32 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  34.32 
 
 		 444 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  34.07 
 
 		 444 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  34.07 
 
 		 444 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  34.07 
 
 		 444 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  34.07 
 
 		 444 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  33.83 
 
 		 444 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  33.83 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  33.58 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  33.83 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  33.83 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  31.09 
 
 		 440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.06 
 
 		 445 aa  216  7e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.93 
 
 		 442 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  31.49 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  34.46 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  34.11 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  36.79 
 
 		 450 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  34.05 
 
 		 471 aa  209  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  34.83 
 
 		 430 aa  209  8e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  33.91 
 
 		 432 aa  209  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  33.64 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  36.8 
 
 		 445 aa  206  8e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  36.1 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  33.41 
 
 		 436 aa  203  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  32.2 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  33.89 
 
 		 451 aa  200  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  31.88 
 
 		 453 aa  200  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  29.78 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  30.17 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  31.31 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  34.42 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  34.15 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  33.68 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  33.25 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  33.42 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  33.18 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  33.33 
 
 		 438 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2843  sun protein  33.25 
 
 		 424 aa  189  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  28.34 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  28.34 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  33.03 
 
 		 439 aa  187  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  34.13 
 
 		 429 aa  186  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  34.13 
 
 		 429 aa  186  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.03 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  32.69 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  31.82 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  34.31 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  29.98 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  33.89 
 
 		 435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  31.54 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  32.43 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  32.45 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  32.45 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  30.31 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  33.74 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  32.59 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  33.48 
 
 		 431 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  33.33 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  29.53 
 
 		 449 aa  180  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  31.41 
 
 		 429 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  32.31 
 
 		 426 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  32.21 
 
 		 428 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  30.7 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>