38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0737 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  77.55 
 
 
481 aa  778    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  76.76 
 
 
483 aa  738    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  970    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  76.72 
 
 
481 aa  736    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  68.39 
 
 
484 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  77.18 
 
 
482 aa  744    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  76.88 
 
 
480 aa  743    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  83.2 
 
 
482 aa  826    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  66.32 
 
 
484 aa  615  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  62.91 
 
 
488 aa  606  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  55.78 
 
 
494 aa  543  1e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  55.17 
 
 
510 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  52.93 
 
 
478 aa  521  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  49.17 
 
 
486 aa  477  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  48.44 
 
 
510 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  62.61 
 
 
412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  48.75 
 
 
489 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  28.66 
 
 
489 aa  182  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  29.56 
 
 
490 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  48.3 
 
 
176 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  27.52 
 
 
487 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  26.82 
 
 
488 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  26.72 
 
 
490 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  28.36 
 
 
487 aa  123  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  24.69 
 
 
515 aa  120  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  24.69 
 
 
492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  26.45 
 
 
538 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  26.51 
 
 
499 aa  94  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  23.94 
 
 
450 aa  91.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  26.91 
 
 
485 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  27.96 
 
 
499 aa  71.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  27.86 
 
 
490 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  22.88 
 
 
522 aa  59.7  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  24.92 
 
 
482 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  26.27 
 
 
477 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  24.26 
 
 
507 aa  57  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5157  hypothetical protein  23.05 
 
 
496 aa  47  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.0750185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2511  hypothetical protein  23 
 
 
511 aa  44.3  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.398866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>