31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0734 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  827    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  67.44 
 
 
391 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  63.86 
 
 
403 aa  535  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  63.85 
 
 
391 aa  535  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  65.38 
 
 
391 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  63.4 
 
 
397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  63.75 
 
 
391 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  55.05 
 
 
404 aa  440  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  52.05 
 
 
392 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  49.87 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  50.38 
 
 
405 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  48.99 
 
 
395 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  48.48 
 
 
395 aa  359  5e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  46.26 
 
 
441 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  35.64 
 
 
394 aa  245  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  35.53 
 
 
384 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  64.23 
 
 
145 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  34.65 
 
 
387 aa  186  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  27.16 
 
 
398 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  33.33 
 
 
413 aa  136  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  33.21 
 
 
429 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  32.11 
 
 
426 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17250  hypothetical protein  31.01 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0788  hypothetical protein  58.82 
 
 
92 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3324  hypothetical protein  52.05 
 
 
101 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0425  hypothetical protein  26.77 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  23.82 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  21.72 
 
 
384 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  22.62 
 
 
381 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157228  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0671  hypothetical protein  28.81 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0584  hypothetical protein  28.77 
 
 
412 aa  46.6  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>