27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0720 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1116  CopG family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 83 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  53.01 
 
 		 86 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3842  CopG family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0145  CopG family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3557  CopG family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1125  CopG family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000121555  unclonable  0.00000692901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1117  transcriptional regulator, CopG family  39.71 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01520  hypothetical protein  33.82 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460812  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0201  hypothetical protein  33.82 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.564458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2717  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3676  hypothetical protein  38.67 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03468  transcriptional regulator, CopG family  28.95 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0445  helix-turn-helix protein, CopG  37.1 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000022622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0944  transcriptional regulator, CopG family  37.5 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.129226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2452  transcriptional regulator, CopG family  37.5 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0142627  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2607  CopG family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4874  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.62267  hitchhiker  0.00867489 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4792  transcriptional regulator, CopG family  42.03 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0479  CopG family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3195  helix-turn-helix protein, CopG  37.5 
 
 		 74 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3570  CopG-like DNA-binding protein  36.62 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00677722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0055  CopG family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1965  CopG-like DNA-binding  48.65 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0374946  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24260  predicted DNA-binding protein with an HTH domain  35.71 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3519  transcriptional regulator, CopG family  30.3 
 
 		 82 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4780  CopG family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 80 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00236164  hitchhiker  0.00756111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>