19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0659 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0659  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 
237 aa  487  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0330  uridine kinase-like  72.73 
 
 
240 aa  337  7e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0269818 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2184  phosphoribulokinase/uridine kinase  57.99 
 
 
233 aa  265  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1431  phosphoribulokinase/uridine kinase  55.09 
 
 
219 aa  246  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0173  uridine kinase-like protein  56.94 
 
 
219 aa  245  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0052  uridine kinase-like  51.69 
 
 
193 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  28.77 
 
 
207 aa  58.9  0.00000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  30.3 
 
 
325 aa  49.7  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4433  uridine kinase  26.09 
 
 
209 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  23.9 
 
 
229 aa  45.4  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  27.1 
 
 
198 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  24.24 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5598  histidinol-phosphate phosphatase family protein  28.57 
 
 
649 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  21.88 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  21.88 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  27.54 
 
 
207 aa  42.4  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  27.54 
 
 
207 aa  42.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  26.51 
 
 
198 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.64 
 
 
558 aa  42  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>