274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0655 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 768 aa  1584    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 760 aa  226  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  27.42 
 
 		 676 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  27.26 
 
 		 676 aa  173  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  27.2 
 
 		 745 aa  168  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  26.6 
 
 		 753 aa  167  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  27.05 
 
 		 749 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  27.05 
 
 		 749 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  26.03 
 
 		 687 aa  163  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  25.56 
 
 		 713 aa  163  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  26.03 
 
 		 709 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  25.61 
 
 		 710 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  25.61 
 
 		 710 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  25.61 
 
 		 710 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 668 aa  162  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  26.75 
 
 		 745 aa  161  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  26.75 
 
 		 745 aa  161  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  26.75 
 
 		 745 aa  161  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  27.88 
 
 		 688 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  27.26 
 
 		 688 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  27.41 
 
 		 688 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  27.57 
 
 		 688 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  25.87 
 
 		 695 aa  157  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  26.65 
 
 		 686 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  25.08 
 
 		 710 aa  153  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 697 aa  153  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 681 aa  151  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  27.13 
 
 		 687 aa  150  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 672 aa  151  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  25.18 
 
 		 691 aa  150  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  27.14 
 
 		 686 aa  148  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  26.86 
 
 		 681 aa  148  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  25.87 
 
 		 723 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  26.98 
 
 		 681 aa  146  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  25.8 
 
 		 684 aa  143  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  26.54 
 
 		 719 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  25.94 
 
 		 667 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  26.23 
 
 		 710 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  27.33 
 
 		 726 aa  138  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  25.25 
 
 		 669 aa  137  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 702 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  26.23 
 
 		 724 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  26.95 
 
 		 668 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 699 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 702 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 683 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  25.36 
 
 		 699 aa  132  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 741 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  27.06 
 
 		 668 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  25.79 
 
 		 661 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 716 aa  125  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 702 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 661 aa  120  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 698 aa  117  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  24.15 
 
 		 687 aa  112  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 685 aa  112  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 744 aa  106  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 696 aa  100  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 718 aa  99.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 685 aa  98.6  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  24.13 
 
 		 701 aa  97.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 713 aa  95.5  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 793 aa  93.6  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  24.34 
 
 		 708 aa  92.8  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 673 aa  92.4  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 713 aa  91.3  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 713 aa  91.3  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  21.56 
 
 		 705 aa  90.1  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 713 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 713 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 713 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 708 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 780 aa  89  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  38.65 
 
 		 668 aa  88.6  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 713 aa  87.8  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 758 aa  85.1  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 750 aa  84.7  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  35.33 
 
 		 662 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 721 aa  79.7  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  35.23 
 
 		 667 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 		 766 aa  79  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 749 aa  77.8  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  22.15 
 
 		 775 aa  77.8  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 705 aa  77.4  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 714 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 766 aa  76.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  27.83 
 
 		 698 aa  75.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 767 aa  75.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  27.83 
 
 		 725 aa  75.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 717 aa  74.7  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.9 
 
 		 681 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.92 
 
 		 696 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6321  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 732 aa  73.9  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  34.97 
 
 		 663 aa  72  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 684 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 773 aa  69.7  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.43 
 
 		 696 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 769 aa  67.8  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 729 aa  66.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22 
 
 		 696 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>