66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0648 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  100 
 
 		 82 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  42.86 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  50.68 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  43.48 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  35.71 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  45.57 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  45.57 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  43.66 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  42.25 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  32.88 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  36.62 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  42.65 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  35.21 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  35.21 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  33.82 
 
 		 796 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  34.25 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  46.67 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  32.39 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  35.62 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  40.98 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  33.82 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  35.29 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  46.43 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  38.24 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  38.24 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  38.24 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  38.24 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  36.76 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  42.37 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  36.76 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  29.58 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  36.76 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  36.76 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  39.39 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  28.57 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  29.41 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  29.41 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1842  SirA family protein  35.59 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483322  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  32.88 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  34.78 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  39.29 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  37.93 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  35.21 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  28.57 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  37.68 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22790  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.94 
 
 		 75 aa  43.9  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  31.88 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.17 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  31.43 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  40 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  36.05 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  25 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  25 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  25 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  25 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  25 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  25 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  25 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  25 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1912  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0447  SirA-like  33.82 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  24.66 
 
 		 75 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  25.71 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  25.71 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  29.41 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>