144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0634 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0634  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  357  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0589  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  75.43 
 
 
177 aa  273  8e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.768385  normal  0.646896 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0571  hypothetical protein  74.86 
 
 
177 aa  269  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.487342 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0730  hypothetical protein  70.62 
 
 
177 aa  267  7e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1587  hypothetical protein  70.62 
 
 
177 aa  265  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0166263 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1962  hypothetical protein  70.62 
 
 
177 aa  264  5.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0548542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0604  hypothetical protein  65.54 
 
 
177 aa  249  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0550  hypothetical protein  44.63 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2017  hypothetical protein  34.87 
 
 
201 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 
208 aa  96.3  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00337979  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1427  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.66 
 
 
218 aa  94  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1303  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.48 
 
 
211 aa  91.3  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4056  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.86 
 
 
204 aa  88.6  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022799  hitchhiker  0.00000194913 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1961  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.13 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00643734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  49.37 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  49.37 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0731  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1586  hypothetical protein  54.29 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.345573  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0492  hypothetical protein  28.36 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.717698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0635  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.04 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.23 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.29 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.946686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0551  hypothetical protein  26.19 
 
 
179 aa  60.8  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1428  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.03 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3099  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.56 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422914  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0491  hypothetical protein  39.74 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.62 
 
 
178 aa  58.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00127684  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4057  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.63 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000796256  hitchhiker  0.000000255237 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.34 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.29 
 
 
140 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.94 
 
 
141 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4088  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 
179 aa  54.7  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1003  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
176 aa  54.3  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.68 
 
 
141 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.68 
 
 
139 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0632  biopolymer transport protein ExbD, putative  31.82 
 
 
139 aa  51.6  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.362389 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.97 
 
 
140 aa  51.6  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  32.69 
 
 
136 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  35.71 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.15 
 
 
138 aa  48.5  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  34.21 
 
 
139 aa  48.5  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  20.69 
 
 
150 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  34.43 
 
 
145 aa  48.5  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.43 
 
 
145 aa  48.5  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2403  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.01 
 
 
135 aa  48.5  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  20.11 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.37 
 
 
137 aa  48.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  20.11 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2764  hypothetical protein  23.76 
 
 
175 aa  47.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.44 
 
 
140 aa  47.8  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  34.83 
 
 
134 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  21.12 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.12 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  39.66 
 
 
143 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  34.29 
 
 
135 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
136 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0054  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.51 
 
 
129 aa  47  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.43 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.29 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
136 aa  46.6  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  32.89 
 
 
139 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.29 
 
 
134 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.29 
 
 
134 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  20.11 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.79 
 
 
140 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.74 
 
 
142 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  30.59 
 
 
146 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.93 
 
 
135 aa  45.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2763  hypothetical protein  21.97 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.861823  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  30.86 
 
 
135 aa  45.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
134 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
134 aa  45.1  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2016  hypothetical protein  36.25 
 
 
175 aa  45.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.71 
 
 
136 aa  45.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
134 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
134 aa  45.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  26.22 
 
 
149 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  26.42 
 
 
135 aa  44.7  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  33.33 
 
 
134 aa  45.1  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2484  putative TonB system transport protein ExbD2  32.79 
 
 
137 aa  44.7  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000778685  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
134 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
134 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
134 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.71 
 
 
136 aa  45.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
134 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
134 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.67 
 
 
136 aa  44.7  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 
134 aa  44.7  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.52 
 
 
136 aa  44.3  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  30 
 
 
133 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  39.29 
 
 
136 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  19.38 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  31.67 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.63 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.85 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
136 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.19 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  33.33 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>