More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0543 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0543  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  66.13 
 
 		 187 aa  258  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.23 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.26 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.6 
 
 		 190 aa  194  9e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.22 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.8 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.51 
 
 		 182 aa  134  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 		 164 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 		 164 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.87 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  43.33 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.23 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  38.56 
 
 		 159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  42.38 
 
 		 173 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  35.83 
 
 		 200 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  33.88 
 
 		 181 aa  121  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  40.34 
 
 		 176 aa  121  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  38.93 
 
 		 162 aa  121  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.33 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  38.86 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.62 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  43.33 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1324  Holliday junction resolvase  36.9 
 
 		 189 aa  117  9e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.67 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.98 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  44.62 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  36.24 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  38.6 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.76 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.553379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2211  Holliday junction resolvase  46.15 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  43.48 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  32.43 
 
 		 184 aa  114  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  34.23 
 
 		 161 aa  114  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.44 
 
 		 160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  41.22 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  43.48 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  41.06 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  41.22 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2104  Holliday junction resolvase  35.1 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0002  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.41 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.075802  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0769  Holliday junction resolvase  34.04 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1215  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0458654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  41.3 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  41.3 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  39.86 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  41.3 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  34.87 
 
 		 164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.4 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1244  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4203  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0438295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0314  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.98 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.290454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.89 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.56 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.46 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  41.22 
 
 		 173 aa  108  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  38.24 
 
 		 173 aa  108  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.74 
 
 		 176 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  40.58 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.58 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  40.58 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  40.58 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  37.13 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1846  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.98 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.018832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4000  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  40.58 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  40.58 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  40.58 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  40.58 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  39.86 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  40.46 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  40.58 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.9 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  37.16 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  39.86 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  39.86 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  39.86 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  39.86 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  42.31 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  41.22 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  39.86 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.78 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  37.84 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  36.91 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  40.58 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  41.22 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.41 
 
 		 167 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2024  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.67 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 175 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  37.84 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>