25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0501 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0501  cytochrome c, putative  100 
 
 		 150 aa  312  9e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412522  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0464  cytochrome c, putative  76.51 
 
 		 151 aa  254  3e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.778169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1983  cytochrome c, putative  67.11 
 
 		 150 aa  224  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000836955  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0507  cytochrome c, putative  70 
 
 		 149 aa  219  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.032773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0224  hypothetical protein  64.58 
 
 		 163 aa  204  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.994888  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1674  cytochrome c, putative  72.87 
 
 		 167 aa  202  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0607  hypothetical protein  63.89 
 
 		 144 aa  200  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0512  cytochrome c, putative  72.13 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1317  hypothetical protein  51.52 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000161565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0545  hypothetical protein  41.84 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7149  hypothetical protein  36.13 
 
 		 438 aa  77.4  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3068  hypothetical protein  32.86 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502421  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0358  hypothetical protein  32.35 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.148188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1472  hypothetical protein  42.31 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.065851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0700  hypothetical protein  36.67 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2389  hypothetical protein  32.03 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.243985  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11733  hypothetical protein  25.52 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0969  hypothetical protein  35.42 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193752 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1848  hypothetical protein  28.77 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08526  hypothetical protein  32.61 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0396  hypothetical protein  27.69 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0181746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3890  hypothetical protein  23.38 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0296  hypothetical protein  27.43 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  28.91 
 
 		 473 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  30.11 
 
 		 464 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>