49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0433 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  55.04 
 
 
237 aa  241  9e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  56.9 
 
 
231 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  51.81 
 
 
243 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  49.38 
 
 
234 aa  206  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  48.74 
 
 
222 aa  194  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  44.35 
 
 
194 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  43.35 
 
 
249 aa  151  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  42.51 
 
 
197 aa  135  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  36.29 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  39.17 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  33.76 
 
 
212 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  31.78 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  31.46 
 
 
202 aa  98.2  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  28.99 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  29.66 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  33.62 
 
 
206 aa  96.3  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  30.33 
 
 
195 aa  92.8  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  31.17 
 
 
215 aa  92.8  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  32.05 
 
 
202 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  35.1 
 
 
190 aa  89.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  29.36 
 
 
213 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  29 
 
 
183 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  30 
 
 
224 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  29.13 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  33.03 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  33.48 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  29.81 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  25.96 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  27.31 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  25.61 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  29.25 
 
 
239 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  31.98 
 
 
373 aa  58.9  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  28.77 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  27.4 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  27.4 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  28.3 
 
 
219 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  26.69 
 
 
357 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  27.5 
 
 
359 aa  52.4  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  32.4 
 
 
373 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  24.27 
 
 
181 aa  46.2  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  24.84 
 
 
409 aa  45.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  24.27 
 
 
181 aa  45.1  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  27.27 
 
 
284 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  25.68 
 
 
380 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  33.33 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  33.33 
 
 
236 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  33.33 
 
 
236 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1125  major outer membrane protein OMP-1T  22.84 
 
 
272 aa  41.6  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>