More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0402 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  54.14 
 
 		 692 aa  654    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  50.66 
 
 		 986 aa  654    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  51.48 
 
 		 985 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  52 
 
 		 883 aa  668    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  55.31 
 
 		 882 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  49.65 
 
 		 979 aa  708    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1215  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 		 1148 aa  672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  53.15 
 
 		 971 aa  641    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  50.22 
 
 		 980 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  60.2 
 
 		 924 aa  742    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  53.02 
 
 		 947 aa  641    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  49.32 
 
 		 908 aa  667    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  70.29 
 
 		 915 aa  1258    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  72.58 
 
 		 1022 aa  1110    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 		 884 aa  661    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  47.67 
 
 		 903 aa  650    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  77.79 
 
 		 986 aa  1124    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0032  translation initiation factor IF-2  53.03 
 
 		 1016 aa  675    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.247962 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  77.99 
 
 		 936 aa  1360    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  51.16 
 
 		 1008 aa  703    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  55.96 
 
 		 732 aa  652    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  53.66 
 
 		 949 aa  642    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  69.56 
 
 		 952 aa  1262    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 911 aa  1825    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  55.13 
 
 		 945 aa  725    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  46.27 
 
 		 921 aa  666    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  67.47 
 
 		 991 aa  1267    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  55.52 
 
 		 943 aa  721    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0141  translation initiation factor IF-2  55.05 
 
 		 1010 aa  702    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  52.82 
 
 		 1029 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  54.92 
 
 		 686 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  54.48 
 
 		 689 aa  632  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  54.92 
 
 		 686 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  53.94 
 
 		 686 aa  629  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  54.58 
 
 		 686 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  54.58 
 
 		 686 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  54.58 
 
 		 686 aa  627  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  54.58 
 
 		 686 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  54.58 
 
 		 686 aa  627  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0653  translation initiation factor IF-2  52.66 
 
 		 1204 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.696738  normal  0.0609071 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  52.23 
 
 		 920 aa  625  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  54.23 
 
 		 688 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  51.68 
 
 		 888 aa  625  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  44.44 
 
 		 907 aa  623  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  54.4 
 
 		 688 aa  625  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  51.63 
 
 		 896 aa  619  1e-176  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.58 
 
 		 822 aa  620  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  50.15 
 
 		 904 aa  616  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  53.25 
 
 		 922 aa  616  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  53.98 
 
 		 845 aa  619  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  50.15 
 
 		 962 aa  618  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  53.52 
 
 		 885 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 885 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 894 aa  615  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 885 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 885 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  52.89 
 
 		 896 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  52.95 
 
 		 705 aa  611  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  51.79 
 
 		 880 aa  608  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  52.95 
 
 		 705 aa  611  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 889 aa  611  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  49.76 
 
 		 879 aa  610  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  52.32 
 
 		 891 aa  605  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  52.73 
 
 		 979 aa  607  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  52.99 
 
 		 964 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  54.05 
 
 		 860 aa  608  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 881 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  52.49 
 
 		 894 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  52.96 
 
 		 898 aa  608  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  53.16 
 
 		 964 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  52.18 
 
 		 997 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  52.7 
 
 		 896 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  51.88 
 
 		 1079 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  51.62 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  51.62 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  46.42 
 
 		 895 aa  603  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  51.62 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  51.62 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  51.27 
 
 		 902 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  54.53 
 
 		 984 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  50.4 
 
 		 892 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  52.19 
 
 		 1079 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  51.46 
 
 		 884 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 882 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 720 aa  601  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  51.18 
 
 		 879 aa  600  1e-170  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  51.06 
 
 		 856 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 		 1161 aa  599  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  51.65 
 
 		 975 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  51.65 
 
 		 975 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  51.65 
 
 		 975 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  51.49 
 
 		 975 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  51.49 
 
 		 975 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 989 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  51.62 
 
 		 843 aa  597  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  54.26 
 
 		 941 aa  598  1e-169  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  48.11 
 
 		 940 aa  598  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  51.04 
 
 		 949 aa  598  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  50.72 
 
 		 943 aa  597  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  52.74 
 
 		 992 aa  597  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>