More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0395 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 277 aa  549  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  52.96 
 
 		 281 aa  296  3e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  52.69 
 
 		 273 aa  257  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  52.87 
 
 		 273 aa  255  6e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  53.01 
 
 		 274 aa  253  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  53.05 
 
 		 271 aa  238  6.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  53.76 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  33.33 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  32.52 
 
 		 281 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  32.52 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  33.79 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  34.07 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 		 261 aa  128  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  35.86 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  40.33 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  32.6 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  31.93 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  35.76 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.73 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  32.73 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  32.46 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  33.22 
 
 		 296 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  33.9 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  32.25 
 
 		 277 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  33.68 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  37.57 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  34.63 
 
 		 288 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  30.83 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  30.83 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  34.66 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  41.1 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  34.16 
 
 		 246 aa  112  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  34.66 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  39.33 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  31.85 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  35.53 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  32.77 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  31.32 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  37.57 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  37.57 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  35.9 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  43.38 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  45.93 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3431  phosphatidate cytidylyltransferase  33.44 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  31.18 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  29.76 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  34.39 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.1 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  31.18 
 
 		 310 aa  105  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  38.2 
 
 		 233 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  30.89 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  40.69 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.94 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  37.23 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  32.26 
 
 		 306 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  31.64 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  30.55 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  42.11 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  42.11 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  42.11 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  42.11 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  38.04 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  45.74 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  42.11 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  35.51 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  42.11 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  35.51 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  41.84 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  42.11 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  42.11 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  42.11 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  42.11 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  42.11 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  46.27 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  28.91 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  42.11 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  42.11 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  32.42 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  36.48 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  29.67 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  31.21 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  34.09 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3512  phosphatidate cytidylyltransferase  28.95 
 
 		 336 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0503603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  32.55 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  32.17 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  29.85 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  42.66 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  36.48 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>