59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0392 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  100 
 
 		 398 aa  805    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  39.54 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  26.38 
 
 		 436 aa  109  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  26.38 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1699  O-antigen polymerase  28.62 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  29.32 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  29.63 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  29.63 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  29.81 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  29.28 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  28 
 
 		 426 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  26.15 
 
 		 432 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  27.83 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  27.35 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  29.12 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  25.1 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  25.1 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  25.98 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  25.98 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  25.98 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  24.82 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  23.95 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  30.34 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  22.26 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  22.66 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  24.14 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  24.31 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02935  hypothetical protein  23.02 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  23.25 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  24.5 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2053  O-antigen polymerase  29.17 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0602  lipid A core--O-antigen ligase  24.32 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 579 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  27.07 
 
 		 773 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  24.04 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  24.85 
 
 		 498 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  26.37 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  25.35 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  24.24 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  23.94 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0780  O-antigen polymerase  22.64 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.292399  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  22.12 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0156  O-antigen polymerase  28.4 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  23.14 
 
 		 537 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  21.7 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  22.8 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1241  hypothetical protein  23.65 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4995  lipid A-core:surface polymer ligase  23.98 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  23.24 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  31.86 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  29.69 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  29.69 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  24.2 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  25.47 
 
 		 496 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1888  hypothetical protein  23.88 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4465  O-antigen polymerase  24.89 
 
 		 479 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000989096  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  21.43 
 
 		 512 aa  43.1  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  31.88 
 
 		 503 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>