100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0372 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1505  hypothetical protein  99.57 
 
 
465 aa  962  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  5.51323e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1926  hypothetical protein  98.92 
 
 
465 aa  956  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43731  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1968  hypothetical protein  92.95 
 
 
466 aa  891  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.360156 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2142  hypothetical protein  99.14 
 
 
465 aa  959  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212429  normal  0.476953 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2613  hypothetical protein  70.68 
 
 
441 aa  685  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2628  hypothetical protein  69.4 
 
 
465 aa  706  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.945312  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2144  hypothetical protein  99.35 
 
 
465 aa  959  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.397175  normal  0.435128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  966  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2416  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  966  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2506  hypothetical protein  99.14 
 
 
465 aa  960  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.277466  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1521  hypothetical protein  98.92 
 
 
465 aa  956  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00409895  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  966  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1156  hypothetical protein  99.14 
 
 
465 aa  959  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247709  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1358  hypothetical protein  98.92 
 
 
465 aa  957  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.250752  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0770  hypothetical protein  98.92 
 
 
465 aa  956  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  99.78 
 
 
465 aa  964  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0702  hypothetical protein  97.71 
 
 
443 aa  883  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0146  hypothetical protein  98.92 
 
 
465 aa  956  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.341189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0649  hypothetical protein  99.57 
 
 
465 aa  961  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.567577  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1857  hypothetical protein  99.57 
 
 
465 aa  962  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  7.86395e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2533  hypothetical protein  55.22 
 
 
439 aa  492  1e-138  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  2.2557e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  25.82 
 
 
420 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  22.72 
 
 
467 aa  68.9  2e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  22.72 
 
 
467 aa  68.9  2e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.61511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  22.72 
 
 
467 aa  68.9  2e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  22.72 
 
 
467 aa  68.9  2e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  22.72 
 
 
467 aa  68.9  2e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  22.52 
 
 
467 aa  68.2  3e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3133  transposase, IS4 family protein  22.52 
 
 
467 aa  66.2  1e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0784  transposase, IS4 family protein  23.72 
 
 
411 aa  65.5  2e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0311  transposase, IS4 family protein  22.59 
 
 
469 aa  65.1  3e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  23.6 
 
 
397 aa  62.8  1e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  23.31 
 
 
397 aa  62.4  2e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  23.31 
 
 
397 aa  62.4  2e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  23.31 
 
 
397 aa  62.4  2e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  23.31 
 
 
397 aa  62.4  2e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0301  transposase IS4 family protein  20.34 
 
 
457 aa  60.1  9e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0333  transposase IS4 family protein  20.34 
 
 
457 aa  60.1  9e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3275  transposase IS4 family protein  20.34 
 
 
457 aa  60.1  9e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1416  transposase IS4 family protein  20.83 
 
 
457 aa  59.3  1e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.73516e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1286  transposase IS4 family protein  20.83 
 
 
457 aa  59.3  1e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  9.08887e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0246  transposase IS4 family protein  20.5 
 
 
457 aa  59.7  1e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  7.88871e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3361  transposase IS4 family protein  20.5 
 
 
457 aa  59.7  1e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.25765e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0508  transposase IS4 family protein  20.5 
 
 
457 aa  59.7  1e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.6026e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1790  transposase IS4 family protein  20.83 
 
 
457 aa  59.3  2e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.50796e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0476  transposase IS4 family protein  20.83 
 
 
457 aa  59.3  2e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.19205e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  26.64 
 
 
447 aa  57  6e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  26.64 
 
 
447 aa  57  6e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1413  transposase IS4 family protein  21.57 
 
 
472 aa  57  8e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  21.57 
 
 
472 aa  57  8e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1197  transposase IS4 family protein  21.57 
 
 
472 aa  57  8e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3072  transposase IS4 family protein  20.34 
 
 
457 aa  56.2  1e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.6062e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1331  transposase, IS4 family protein  24.01 
 
 
484 aa  55.8  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1930  transposase, IS4 family protein  24.01 
 
 
484 aa  55.8  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1994  transposase, IS4 family protein  24.01 
 
 
484 aa  55.8  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0476  transposase, IS4 family protein  24.01 
 
 
484 aa  55.8  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  21.57 
 
 
472 aa  55.5  2e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1919  transposase IS4 family protein  20.13 
 
 
457 aa  55.8  2e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00491229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1020  transposase IS4 family protein  21.57 
 
 
472 aa  55.5  2e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267624  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2637  transposase, IS4 family protein  24.01 
 
 
484 aa  55.8  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.523228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0873  transposase, IS4 family protein  24.01 
 
 
484 aa  55.8  2e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.446345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0530  transposase, IS4 family protein  22.91 
 
 
331 aa  54.7  4e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0296  transposase, IS4 family protein  23.75 
 
 
484 aa  54.3  5e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0017  transposase, IS4 family protein  24.83 
 
 
468 aa  50.4  6e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0019  transposase, IS4 family protein  24.83 
 
 
468 aa  50.4  6e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0269  transposase, IS4 family protein  24.83 
 
 
468 aa  50.4  6e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0352  transposase, IS4 family protein  24.83 
 
 
468 aa  50.4  6e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0262  transposase, IS4 family protein  24.83 
 
 
468 aa  50.4  6e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2289  transposase, IS4 family protein  22.31 
 
 
484 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2248  transposase, IS4 family protein  22.31 
 
 
484 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1775  transposase, IS4 family protein  22.31 
 
 
484 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0449  transposase, IS4 family protein  22.31 
 
 
484 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0436  transposase, IS4 family protein  22.31 
 
 
484 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0321608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0310  hypothetical protein  24.4 
 
 
253 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0334982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2903  transposase, IS4 family protein  22.31 
 
 
484 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  25.43 
 
 
447 aa  46.6  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1145  hypothetical protein  22.07 
 
 
291 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1019  transposase IS4 family protein  23.1 
 
 
468 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.865831  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2437  transposase IS4 family protein  23.1 
 
 
468 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1258  transposase IS4 family protein  23.1 
 
 
468 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  9.86472e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0956  transposase IS4 family protein  23.1 
 
 
468 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0821634  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1453  transposase IS4 family protein  23.1 
 
 
468 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.243782  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1579  transposase IS4 family protein  23.1 
 
 
468 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2157  transposase IS4 family protein  23.1 
 
 
468 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2110  transposase IS4 family protein  23.1 
 
 
468 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0566508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  21.53 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2153  transposase IS4 family protein  23.1 
 
 
468 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  21.66 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  21.66 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  21.53 
 
 
473 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4092  transposase, IS4 family protein  26.92 
 
 
433 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0163  transposase, IS4 family protein  26.92 
 
 
433 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0435  transposase, IS4 family protein  26.92 
 
 
433 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0632  transposase, IS4 family protein  26.92 
 
 
433 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>