More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0343 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
774 aa  1597    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  77.19 
 
 
750 aa  1199    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  65.26 
 
 
752 aa  974    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  63.38 
 
 
762 aa  951    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  61.05 
 
 
760 aa  964    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  64.14 
 
 
755 aa  978    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  65.58 
 
 
730 aa  989    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  41.92 
 
 
783 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  37.35 
 
 
743 aa  473  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  36.83 
 
 
762 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  39.91 
 
 
821 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  41.36 
 
 
742 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  40.06 
 
 
838 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
768 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  38.64 
 
 
841 aa  455  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  41.42 
 
 
743 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  38.6 
 
 
850 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  40.44 
 
 
826 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  41.42 
 
 
743 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  37.41 
 
 
740 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.75 
 
 
834 aa  452  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  41.11 
 
 
743 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  41.56 
 
 
787 aa  452  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  37.96 
 
 
759 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.86 
 
 
846 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  37.82 
 
 
810 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  37.66 
 
 
786 aa  444  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  39.01 
 
 
846 aa  445  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  38.87 
 
 
801 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  40.65 
 
 
732 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  37.75 
 
 
862 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  37.9 
 
 
857 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  34.9 
 
 
772 aa  429  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  41.1 
 
 
728 aa  432  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  37.75 
 
 
870 aa  432  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  38.18 
 
 
857 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  38.18 
 
 
857 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  38.37 
 
 
844 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  38.37 
 
 
839 aa  429  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  38.37 
 
 
844 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  38.37 
 
 
928 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  37.61 
 
 
858 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  38.37 
 
 
844 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  36.98 
 
 
767 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  38.37 
 
 
844 aa  429  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  36.75 
 
 
794 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  38.37 
 
 
839 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  38.39 
 
 
787 aa  425  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  37.13 
 
 
765 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  38.62 
 
 
846 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  38.02 
 
 
888 aa  422  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
686 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  35.1 
 
 
773 aa  412  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  35.06 
 
 
785 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  37.98 
 
 
698 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  35.19 
 
 
786 aa  400  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  36.56 
 
 
854 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  37.48 
 
 
675 aa  402  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  34.48 
 
 
850 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  37.22 
 
 
678 aa  399  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  33.88 
 
 
815 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  35.25 
 
 
776 aa  392  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  34.61 
 
 
795 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  36.68 
 
 
648 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  35.72 
 
 
907 aa  378  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.65 
 
 
646 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.68 
 
 
648 aa  379  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  32.82 
 
 
809 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  32.1 
 
 
818 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  31.55 
 
 
827 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  32.32 
 
 
796 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  31.83 
 
 
748 aa  364  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  34.4 
 
 
806 aa  363  7.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  31.82 
 
 
818 aa  362  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  32.22 
 
 
819 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  31.39 
 
 
829 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  33.04 
 
 
802 aa  362  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  31.76 
 
 
819 aa  361  3e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  31.35 
 
 
819 aa  360  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.3 
 
 
661 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  35.85 
 
 
776 aa  349  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  32.33 
 
 
833 aa  348  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  34.17 
 
 
734 aa  347  4e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  32.08 
 
 
804 aa  346  8e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  31.88 
 
 
797 aa  346  8.999999999999999e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  34 
 
 
797 aa  346  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34.25 
 
 
732 aa  346  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  34.02 
 
 
811 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  32.27 
 
 
777 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  32.1 
 
 
823 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  33.85 
 
 
713 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  33.85 
 
 
713 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  33.85 
 
 
713 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 
793 aa  343  8e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  33.38 
 
 
713 aa  343  9e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  31.98 
 
 
823 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  33.48 
 
 
713 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  33.48 
 
 
713 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  33.48 
 
 
713 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  31.46 
 
 
771 aa  342  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>