181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0334 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  100 
 
 		 430 aa  892    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  34.3 
 
 		 456 aa  200  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  30.05 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  41.13 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  43.98 
 
 		 290 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  45.36 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.63 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  41.49 
 
 		 433 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  80.46 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  27.45 
 
 		 363 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  31.31 
 
 		 454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.94 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.09 
 
 		 433 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  26.5 
 
 		 417 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  33.1 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  32.73 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1218  restriction modification system DNA specificity subunit  31.82 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.67755  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  30.4 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  27.05 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3985  restriction modification system DNA specificity subunit  37.57 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0844  restriction endonuclease S subunits-like protein  35.9 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.31 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3425  restriction endonuclease S subunits-like  27.58 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835151  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  31.93 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  33.64 
 
 		 511 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  30.63 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  31.89 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  0.0000192379 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  26.16 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3173  restriction modification system, type I  38.51 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000000252983 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.1 
 
 		 444 aa  100  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  26.42 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  28.76 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2924  restriction endonuclease S subunit  39.05 
 
 		 394 aa  96.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  29.69 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  30.16 
 
 		 438 aa  94.4  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0500  restriction modification system DNA specificity subunit  23.56 
 
 		 413 aa  93.2  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.565018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0333  restriction modification system DNA specificity subunit  34.23 
 
 		 371 aa  90.9  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12774  type I restriction/modification system specificity determinant hsdS  37.16 
 
 		 364 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  23.64 
 
 		 425 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  29.52 
 
 		 374 aa  88.2  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  25.71 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  23.13 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  24.93 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.57 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  24.35 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.65 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1176  restriction modification system DNA specificity subunit  26.79 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.882603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  22.9 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3152  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  38.26 
 
 		 141 aa  77.8  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.218767  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1536  restriction modification system DNA specificity domain  22.7 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  19.94 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  26.29 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000406123 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  26.52 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1094  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.07 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0782363  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.04 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3607  restriction modification system, type I  29.47 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4880  putative type I restriction-modification system S subunit  29.94 
 
 		 571 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.960431 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  27.67 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3010  restriction endonuclease S subunits-like protein  25.09 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116402  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  23.4 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.12 
 
 		 417 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000683293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.1 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  25.41 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  23.8 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  24.08 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0403  restriction modification system DNA specificity subunit  24.04 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.56 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1281  restriction modification system DNA specificity subunit  34.43 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  26.26 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  23.61 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2180  restriction modification system DNA specificity subunit  28.03 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  23.8 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0160  restriction modification system DNA specificity subunit  26.41 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  23.98 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3351  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  25.75 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00146581  normal  0.0102246 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  22.4 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  31.54 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  21.85 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1260  restriction modification system DNA specificity subunit  26.44 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  24.78 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  22.3 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3352  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  25.97 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000513186  normal  0.0100815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  26.16 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  20.15 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3914  Restriction endonuclease S subunit  25.28 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1544  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.83 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1842  restriction modification system DNA specificity subunit  26.56 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  22.84 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  24.49 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  34.88 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  23.83 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  25 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  27.21 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.43 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2548  restriction modification system DNA specificity domain  24.36 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  25.14 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  20.44 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  25 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.6 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0987  restriction modification system DNA specificity subunit  28.75 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>