More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0316 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 229 aa  467  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0285  50S ribosomal protein L1  83.84 
 
 		 229 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105773  hitchhiker  0.00394818 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  75.98 
 
 		 229 aa  364  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0230  50S ribosomal protein L1  79.48 
 
 		 229 aa  363  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000338743  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  79.04 
 
 		 229 aa  363  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1965  50S ribosomal protein L1  78.17 
 
 		 229 aa  351  4e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0834753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2682  50S ribosomal protein L1  78.6 
 
 		 229 aa  350  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286692  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  64.25 
 
 		 232 aa  305  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  62.61 
 
 		 232 aa  293  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  62.44 
 
 		 232 aa  294  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  59.29 
 
 		 231 aa  291  7e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 236 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  60.45 
 
 		 231 aa  284  7e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_002950  PG0391  50S ribosomal protein L1  60.73 
 
 		 232 aa  281  7.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  59.11 
 
 		 232 aa  280  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  61.84 
 
 		 232 aa  278  7e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00040  50S ribosomal protein L1  59.38 
 
 		 232 aa  278  7e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  60.83 
 
 		 229 aa  277  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0846  50S ribosomal protein L1  59.55 
 
 		 232 aa  276  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.408948 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  58.82 
 
 		 230 aa  274  9e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  60.1 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  58.45 
 
 		 236 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0423  50S ribosomal protein L1  57.99 
 
 		 229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000383524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  56.62 
 
 		 235 aa  268  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  59.09 
 
 		 233 aa  268  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  59.91 
 
 		 232 aa  267  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  59.36 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  61.46 
 
 		 235 aa  267  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  59.09 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  56.36 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  58.9 
 
 		 233 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1707  50S ribosomal protein L1  58.56 
 
 		 229 aa  264  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 242 aa  262  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  54.09 
 
 		 231 aa  262  4e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  54.71 
 
 		 241 aa  261  4e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  56.82 
 
 		 235 aa  262  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  53.18 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  53.18 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 233 aa  261  6.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  54.71 
 
 		 236 aa  261  8.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  58.64 
 
 		 230 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  55.61 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  54.71 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  57.99 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  57.53 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  58.18 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  55 
 
 		 234 aa  259  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  58.64 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  58.64 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  58.64 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  58.64 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  58.64 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  58.64 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  58.64 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  56.62 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  58.18 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  58.64 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  53.64 
 
 		 235 aa  257  8e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  55.16 
 
 		 238 aa  258  8e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  56.22 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  55.2 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  56.36 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  55.45 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  59.8 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  58.37 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  52.91 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  59.8 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  59.8 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  51.95 
 
 		 235 aa  255  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  53.88 
 
 		 237 aa  254  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  58.18 
 
 		 230 aa  254  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  54.79 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  59.8 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  55.25 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  54.34 
 
 		 238 aa  251  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  57.35 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  56.62 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  53.12 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  52.68 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  52.94 
 
 		 226 aa  249  4e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1666  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  54.09 
 
 		 235 aa  248  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  53.88 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  50 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  53.46 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  56.62 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  57.6 
 
 		 230 aa  245  4e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  55.2 
 
 		 231 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  54.55 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  50.68 
 
 		 230 aa  244  8e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 239 aa  243  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  56.82 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>