More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0315 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0315  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000425279  hitchhiker  0.000807121 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  91.43 
 
 		 141 aa  261  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  86.43 
 
 		 141 aa  243  6e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1966  50S ribosomal protein L11  88.65 
 
 		 141 aa  229  8.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0192  50S ribosomal protein L11  86.43 
 
 		 141 aa  229  8.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000446828  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2683  50S ribosomal protein L11  87.23 
 
 		 141 aa  225  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000789076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0229  50S ribosomal protein L11  85 
 
 		 141 aa  221  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00138343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  78.1 
 
 		 140 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  75 
 
 		 140 aa  214  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  72.86 
 
 		 141 aa  214  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 		 141 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 		 141 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 141 aa  212  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  72.86 
 
 		 141 aa  210  5.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  68.57 
 
 		 141 aa  210  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  74.29 
 
 		 140 aa  210  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  72.86 
 
 		 140 aa  209  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  71.63 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  71.53 
 
 		 140 aa  207  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  71.53 
 
 		 140 aa  207  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  72.14 
 
 		 140 aa  207  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  73.57 
 
 		 140 aa  206  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  73.57 
 
 		 140 aa  206  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  71.94 
 
 		 141 aa  206  9e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 147 aa  205  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  68.61 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  72.14 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  69.34 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  70.42 
 
 		 143 aa  204  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  72.14 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 		 140 aa  203  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  72.14 
 
 		 140 aa  204  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  69.78 
 
 		 163 aa  203  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  71.13 
 
 		 142 aa  203  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  73.19 
 
 		 142 aa  203  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  73.19 
 
 		 142 aa  203  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  71.94 
 
 		 141 aa  203  8e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  71.13 
 
 		 143 aa  202  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  69.34 
 
 		 140 aa  202  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  68.61 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3864  50S ribosomal protein L11  69.72 
 
 		 142 aa  200  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000881502  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0335  50S ribosomal protein L11  69.72 
 
 		 142 aa  200  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00120454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1706  ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 147 aa  200  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  72.46 
 
 		 142 aa  200  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  72.46 
 
 		 142 aa  199  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  70.07 
 
 		 141 aa  200  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  70.5 
 
 		 141 aa  199  8e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  199  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  71.74 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  69.72 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  72.46 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  69.01 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  71.22 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  68.61 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  70.29 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 144 aa  196  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  67.61 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 147 aa  196  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  70.5 
 
 		 144 aa  196  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 141 aa  195  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 147 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 143 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  67.61 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 145 aa  195  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0273  ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 142 aa  194  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225698  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  69.01 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>