More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0308 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  74.71 
 
 
691 aa  1109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  76.38 
 
 
691 aa  1120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  79.71 
 
 
690 aa  1174  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  4.80322e-05 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  75.91 
 
 
691 aa  1138  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  76.09 
 
 
691 aa  1140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  100 
 
 
693 aa  1433  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  74.56 
 
 
690 aa  1107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  41.84 
 
 
695 aa  600  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  41.87 
 
 
707 aa  589  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  3.13892e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  42.07 
 
 
679 aa  583  1e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  39.16 
 
 
692 aa  575  1e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  38.71 
 
 
695 aa  570  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  40.38 
 
 
694 aa  565  1e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.76436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  39.74 
 
 
694 aa  560  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  42.21 
 
 
694 aa  558  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  39.94 
 
 
673 aa  541  1e-152  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  38.34 
 
 
694 aa  540  1e-152  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  39.22 
 
 
699 aa  541  1e-152  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  39.53 
 
 
696 aa  540  1e-152  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  37.66 
 
 
691 aa  540  1e-152  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  38.71 
 
 
689 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  39.05 
 
 
692 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.24117e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  39.39 
 
 
696 aa  538  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  38.43 
 
 
701 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  38.16 
 
 
697 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  39.85 
 
 
680 aa  533  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  38.1 
 
 
696 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7102  elongation factor G  39.43 
 
 
710 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  37.04 
 
 
696 aa  530  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  38.66 
 
 
688 aa  528  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  37.21 
 
 
697 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  38.73 
 
 
682 aa  525  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  5.72853e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  38.73 
 
 
667 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  39.36 
 
 
670 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  37.05 
 
 
692 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  38.14 
 
 
701 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  36.91 
 
 
697 aa  519  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  38.12 
 
 
697 aa  518  1e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  36.98 
 
 
693 aa  513  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  37.26 
 
 
692 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  3.92838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  37.26 
 
 
692 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  37.41 
 
 
692 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.90247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  38.79 
 
 
673 aa  510  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  37.11 
 
 
692 aa  510  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  37.12 
 
 
697 aa  509  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  37.26 
 
 
692 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  6.47757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  37.26 
 
 
692 aa  511  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  37.26 
 
 
692 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.10071e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  37.68 
 
 
693 aa  510  1e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.03063e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  37.41 
 
 
692 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.43993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  36.35 
 
 
692 aa  507  1e-142  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.05392e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  36.48 
 
 
693 aa  508  1e-142  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  5.9659e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  37.11 
 
 
692 aa  508  1e-142  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.76822e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  37.11 
 
 
692 aa  508  1e-142  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.09677e-07  unclonable  1.50309e-24 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  36.52 
 
 
692 aa  506  1e-142  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  36.82 
 
 
692 aa  506  1e-142  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.83321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  37.92 
 
 
692 aa  502  1e-141  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  36.36 
 
 
691 aa  503  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  9.20124e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  36.95 
 
 
691 aa  502  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  36.73 
 
 
689 aa  500  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.11404e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  35.94 
 
 
691 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  37.32 
 
 
703 aa  501  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  37 
 
 
692 aa  501  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  36.9 
 
 
699 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.03691e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  35.59 
 
 
703 aa  498  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  5.74662e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  36.25 
 
 
701 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  37.54 
 
 
692 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  36.7 
 
 
692 aa  498  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  1.42734e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  37.05 
 
 
699 aa  498  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  37.1 
 
 
689 aa  495  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.06199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  36.8 
 
 
692 aa  498  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  36.51 
 
 
691 aa  493  1e-138  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  36.27 
 
 
692 aa  494  1e-138  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  5.56702e-06  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  36.51 
 
 
691 aa  493  1e-138  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  36.66 
 
 
691 aa  492  1e-138  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  37 
 
 
692 aa  494  1e-138  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.23332e-20 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  36.75 
 
 
691 aa  495  1e-138  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  2.60019e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  36.14 
 
 
701 aa  493  1e-138  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0570  elongation factor G  36.62 
 
 
693 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0933  elongation factor G  34.97 
 
 
719 aa  489  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  36.4 
 
 
692 aa  490  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  36.42 
 
 
691 aa  491  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  36.18 
 
 
697 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  36.12 
 
 
692 aa  490  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  35.81 
 
 
699 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  35.96 
 
 
694 aa  489  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  35.81 
 
 
699 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  1.39334e-08 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  35.15 
 
 
691 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0584  elongation factor G  36.62 
 
 
693 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  7.68044e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  37.59 
 
 
697 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  8.53268e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  36.13 
 
 
701 aa  488  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  34.85 
 
 
691 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  35.6 
 
 
695 aa  487  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  3.03107e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  36.18 
 
 
691 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  35.15 
 
 
691 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  37.76 
 
 
682 aa  488  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  36.18 
 
 
697 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  35.67 
 
 
692 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  34.79 
 
 
704 aa  486  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  3.38261e-05  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  35.88 
 
 
691 aa  488  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>