55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0279 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0279  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000202492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0243  hypothetical protein  42.86 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0859173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2000  hypothetical protein  37.8 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.426888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2349  hypothetical protein  36.07 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.827398  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2723  hypothetical protein  35.48 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0116668  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0182  hypothetical protein  32 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.3 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.98 
 
 		 388 aa  52.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1128  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.19 
 
 		 354 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.180858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  40.98 
 
 		 407 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 360 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 360 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  43.28 
 
 		 366 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.15 
 
 		 376 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  43.28 
 
 		 366 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  41.79 
 
 		 345 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0392  RND family efflux transporter MFP subunit  40.35 
 
 		 370 aa  50.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3128  secretion protein HlyD  42.59 
 
 		 370 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000130607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.13 
 
 		 386 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0059  RND family efflux transporter MFP subunit  38.57 
 
 		 411 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.68 
 
 		 353 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.5 
 
 		 374 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  40.32 
 
 		 364 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  40.35 
 
 		 371 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  35.21 
 
 		 442 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  33.8 
 
 		 576 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0583  HlyD family secretion protein  46.3 
 
 		 334 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  33.8 
 
 		 445 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  33.8 
 
 		 445 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1741  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.54 
 
 		 381 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2153  HlyD family secretion protein  38.98 
 
 		 359 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4052  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.79 
 
 		 343 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.048346  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.68 
 
 		 377 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4085  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.79 
 
 		 342 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2827  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00918161  hitchhiker  0.00100699 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 		 410 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5992  RND family efflux transporter MFP subunit  38.6 
 
 		 405 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1818  RND family efflux transporter MFP subunit  32.73 
 
 		 352 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224471  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1581  secretion protein HlyD  38.67 
 
 		 396 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0301644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  28.43 
 
 		 373 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.39 
 
 		 425 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.104314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3248  RND family efflux transporter MFP subunit  43.08 
 
 		 375 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122145  hitchhiker  0.000539204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3743  RND family efflux transporter MFP subunit  30.53 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2104  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 		 450 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.58 
 
 		 434 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 399 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  29.58 
 
 		 433 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3942  cell wall surface anchor family protein  40 
 
 		 343 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3056  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.85 
 
 		 395 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 		 463 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 		 457 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.35 
 
 		 365 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.35 
 
 		 365 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 		 469 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.68 
 
 		 376 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>