265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0278 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 441 aa  894    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  63.21 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  47.74 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  47.06 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  48.32 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  46.49 
 
 		 413 aa  375  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  44.84 
 
 		 445 aa  348  9e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  28.4 
 
 		 448 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  28.03 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  26.84 
 
 		 447 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 		 458 aa  110  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  27.15 
 
 		 437 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  26.91 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  23.24 
 
 		 470 aa  92.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 515 aa  88.2  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.21 
 
 		 467 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.3 
 
 		 483 aa  87.8  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 470 aa  87  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 		 443 aa  86.7  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  23.49 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.61 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  26.03 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 535 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  21.66 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  24.18 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.31 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  22.17 
 
 		 1496 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  23.15 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  22.09 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  20.5 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.86 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.92 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  22.56 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  23.52 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  21.32 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 496 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.2 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1690  outer membrane efflux protein  37.89 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  19.27 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  22.08 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  21.8 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.7 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  27.64 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  27.4 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  21.44 
 
 		 972 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  23.85 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  21.02 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 627 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  20.61 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.98 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.56 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  20.78 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  22.98 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.38 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  21.56 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.13 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.28 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 470 aa  57  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01671  RND family outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 526 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  26.96 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3941  outer membrane efflux protein  33.66 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 508 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.81 
 
 		 522 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  21.02 
 
 		 481 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 526 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.45 
 
 		 455 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 463 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.8 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.8 
 
 		 478 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>