209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0275 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
213 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.9 
 
 
218 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.41 
 
 
218 aa  263  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.18 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.19 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.94 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.14 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.06 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1436  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  34.23 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.878923  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  31.4 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.78 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  31.4 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.43 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.61 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.67 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.21 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.17 
 
 
195 aa  61.6  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  33.09 
 
 
189 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.09 
 
 
189 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.33 
 
 
189 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.33 
 
 
189 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5391  hypothetical protein  31.62 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.33 
 
 
189 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.58 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  30 
 
 
158 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.81 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.33 
 
 
189 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  26.67 
 
 
221 aa  58.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.17 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  32.26 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.17 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.97 
 
 
170 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  34.09 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  27.78 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.33 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  36.8 
 
 
166 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  31.54 
 
 
139 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.61 
 
 
189 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.61 
 
 
189 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.65 
 
 
209 aa  55.1  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.03 
 
 
157 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.11 
 
 
147 aa  54.7  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.52 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31 
 
 
157 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.16 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.7 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1260  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.19 
 
 
159 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.03 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.97 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  33.64 
 
 
1020 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.33 
 
 
166 aa  52.4  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.4 
 
 
157 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.52 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.72 
 
 
188 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  30.97 
 
 
163 aa  52  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  30.48 
 
 
167 aa  52  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.54 
 
 
158 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.11 
 
 
222 aa  52  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.44 
 
 
142 aa  51.6  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  25.71 
 
 
209 aa  51.6  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.48 
 
 
284 aa  51.6  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  29.17 
 
 
157 aa  51.6  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0483  hypothetical protein  32.71 
 
 
168 aa  51.6  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.14 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  26.47 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  27.62 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1442  hypothetical protein  28.81 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2639  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.11 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0013  hypothetical protein  28.81 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2029  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.7 
 
 
161 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000425437  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1520  hypothetical protein  28.81 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.65 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.68 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  28.71 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.88 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  30.48 
 
 
273 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.46 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.77 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.76 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.46 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.88 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.46 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1162  hypothetical protein  28.81 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0016  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  28.81 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0017  hypothetical protein  28.81 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  27.45 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.88 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  26.88 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.64 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.47 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  26.42 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5364  hypothetical protein  29.29 
 
 
209 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865399  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  28.09 
 
 
248 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.97 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  30.11 
 
 
222 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>