More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0238 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 363 aa  748    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  82.32 
 
 		 381 aa  601  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  77.13 
 
 		 363 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  76.45 
 
 		 363 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  74.24 
 
 		 363 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  77.35 
 
 		 312 aa  509  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2380  peptide chain release factor 2  87.95 
 
 		 249 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  53.08 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  52.01 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  51.31 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  48.74 
 
 		 371 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  51.09 
 
 		 326 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  49 
 
 		 364 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  50.58 
 
 		 347 aa  342  7e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  49.41 
 
 		 372 aa  339  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5492  peptide chain release factor 2  49.86 
 
 		 362 aa  338  9e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0496262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  49.71 
 
 		 372 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  47.41 
 
 		 367 aa  336  3.9999999999999995e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  47.13 
 
 		 354 aa  333  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  48.75 
 
 		 383 aa  332  6e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  48.7 
 
 		 380 aa  331  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  47.25 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  48.41 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  48.53 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  46.82 
 
 		 357 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  48.83 
 
 		 349 aa  329  4e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  49.04 
 
 		 371 aa  329  4e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  48.7 
 
 		 380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  49.55 
 
 		 367 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  48.41 
 
 		 380 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  48.08 
 
 		 361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  48.54 
 
 		 349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  50.76 
 
 		 375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  45.81 
 
 		 382 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  47.98 
 
 		 367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  46.51 
 
 		 364 aa  325  5e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  45.43 
 
 		 391 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  45.43 
 
 		 391 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  51.03 
 
 		 364 aa  325  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 327 aa  324  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  45.43 
 
 		 391 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  50.63 
 
 		 371 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 		 369 aa  324  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  46.97 
 
 		 357 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  44.88 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 330 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  45.69 
 
 		 355 aa  322  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2832  peptide chain release factor 2  47.94 
 
 		 358 aa  322  5e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.909356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  48.7 
 
 		 366 aa  322  6e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  44.29 
 
 		 391 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  47.26 
 
 		 357 aa  322  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  50.79 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  50.79 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  46.65 
 
 		 378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  48.24 
 
 		 354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  48.17 
 
 		 340 aa  319  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  50.47 
 
 		 326 aa  319  6e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  46.4 
 
 		 349 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  47.27 
 
 		 374 aa  318  1e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 		 326 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  48.63 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  46.31 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  48.53 
 
 		 367 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  47.79 
 
 		 368 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  45.43 
 
 		 373 aa  315  6e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  44.28 
 
 		 367 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  44.28 
 
 		 367 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  48.11 
 
 		 329 aa  315  6e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  47.14 
 
 		 374 aa  314  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  46.02 
 
 		 365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  46.02 
 
 		 365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  51.03 
 
 		 317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  49.07 
 
 		 331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  45.71 
 
 		 417 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  44.83 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  45.86 
 
 		 366 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  46.02 
 
 		 365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  48.39 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  46.02 
 
 		 365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  45.72 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  46.82 
 
 		 364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  47.6 
 
 		 365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  48.9 
 
 		 331 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4122  peptide chain release factor 2  52.1 
 
 		 304 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  48.72 
 
 		 378 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  47.29 
 
 		 379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  46.45 
 
 		 377 aa  312  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  51.32 
 
 		 310 aa  312  4.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  43.99 
 
 		 367 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  47.51 
 
 		 362 aa  312  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  43.73 
 
 		 372 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  46.24 
 
 		 372 aa  311  7.999999999999999e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  45.72 
 
 		 365 aa  311  9e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2878  peptide chain release factor 2  46.26 
 
 		 364 aa  311  9e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  47.8 
 
 		 357 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  46.02 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1048  hypothetical protein  46.75 
 
 		 332 aa  311  1e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  46.31 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>