More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0179 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  100 
 
 		 78 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  95.89 
 
 		 78 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  94.52 
 
 		 78 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  94.52 
 
 		 78 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0174  acyl carrier protein  93.33 
 
 		 80 aa  135  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  88.31 
 
 		 79 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1661  acyl carrier protein  84.42 
 
 		 79 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 76 aa  100  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 77 aa  100  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  65.67 
 
 		 78 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  65.67 
 
 		 78 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 82 aa  97.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  64.29 
 
 		 79 aa  97.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 82 aa  97.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  61.64 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  57.89 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  61.43 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  57.69 
 
 		 79 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  57.69 
 
 		 79 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  57.69 
 
 		 79 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  60 
 
 		 79 aa  94.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  58.33 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  59.72 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  61.43 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  60 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  61.33 
 
 		 76 aa  92  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  56.16 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  56.16 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  60.81 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  64.18 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 78 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  56.94 
 
 		 84 aa  90.9  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 79 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 78 aa  90.9  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  58.67 
 
 		 77 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  57.53 
 
 		 78 aa  90.5  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  58.97 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  61.76 
 
 		 76 aa  90.1  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 79 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  56.16 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  54.67 
 
 		 81 aa  89.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  55.41 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  57.75 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  60 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  56 
 
 		 77 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  56 
 
 		 77 aa  88.6  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 77 aa  88.6  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  62.32 
 
 		 79 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>