More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0172 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 648 aa  665    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 653 aa  688    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 662 aa  776    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 		 646 aa  714    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 644 aa  696    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  75.11 
 
 		 657 aa  1064    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  80.27 
 
 		 657 aa  1111    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 		 647 aa  707    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 		 641 aa  716    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  73.75 
 
 		 677 aa  1044    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  72.49 
 
 		 657 aa  1031    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 659 aa  1361    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 647 aa  642    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  74.66 
 
 		 657 aa  1059    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 649 aa  652    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 645 aa  715    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 647 aa  694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  74.2 
 
 		 675 aa  1043    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 648 aa  633  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 644 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 652 aa  628  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 634 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 635 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 645 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 648 aa  607  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 637 aa  605  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 630 aa  608  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 645 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 633 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 636 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 645 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 608 aa  604  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 636 aa  599  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 645 aa  600  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 645 aa  601  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 643 aa  601  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 639 aa  601  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 604 aa  598  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 635 aa  602  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 645 aa  599  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 645 aa  601  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 645 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 643 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 645 aa  595  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 634 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 635 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 639 aa  595  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 643 aa  595  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 635 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 638 aa  595  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 647 aa  593  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 647 aa  591  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 644 aa  588  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 644 aa  591  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 644 aa  591  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 608 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 648 aa  585  1e-166  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 648 aa  585  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 736 aa  583  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 646 aa  580  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 639 aa  578  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 615 aa  579  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 645 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 610 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 636 aa  578  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 596 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 636 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 639 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 639 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 659 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 604 aa  576  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 639 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 639 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 645 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 639 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 637 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 635 aa  571  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 640 aa  569  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 638 aa  569  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 640 aa  569  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 640 aa  571  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 639 aa  571  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0982  threonyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 652 aa  571  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0768948  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2841  threonyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 606 aa  569  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 640 aa  568  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1192  threonyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 652 aa  563  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 646 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 631 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 607 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 641 aa  561  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 607 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 638 aa  555  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 640 aa  555  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 643 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 636 aa  553  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>