215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0142 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0142  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
107 aa  223  8e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.596952  normal  0.717523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0338  protein of unknown function DUF45  83.33 
 
 
102 aa  178  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.860406 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0312  protein of unknown function DUF45  79.05 
 
 
106 aa  170  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.137336 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0842  hypothetical protein  66.98 
 
 
111 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0970  protein of unknown function DUF45  66.98 
 
 
111 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473345  normal  0.177309 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2282  protein of unknown function DUF45  47.78 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.879838  hitchhiker  0.00256901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2219  protein of unknown function DUF45  47.78 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2686  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1669  metal-dependent hydrolase-like  47.56 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000580277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4387  hypothetical protein  49.4 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177424  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3111  metal-dependent hydrolase  39.36 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1808  protein of unknown function DUF45  48.19 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0228  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1091  protein of unknown function DUF45  44.58 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00838265  normal  0.159075 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0259  hypothetical protein  38.95 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1174  hypothetical protein  45.78 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1155  metal-dependent hydrolase-like  46.67 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439664  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1569  hypothetical protein  40.66 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184826  unclonable  0.0000116524 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  37.08 
 
 
239 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0804  zinc metalloprotease, putative  35.05 
 
 
229 aa  60.1  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  39.71 
 
 
246 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  36.67 
 
 
224 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  35.48 
 
 
224 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  35.29 
 
 
237 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  34.94 
 
 
253 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1094  protein of unknown function DUF45  40.48 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  35.29 
 
 
241 aa  57.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  43.42 
 
 
242 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  32.58 
 
 
259 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1899  hypothetical protein  36.59 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  30.68 
 
 
241 aa  57  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  34.78 
 
 
244 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  32.35 
 
 
206 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  30.68 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  35.79 
 
 
223 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  41.54 
 
 
245 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  35.35 
 
 
247 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  27.08 
 
 
215 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  29.17 
 
 
242 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  29.03 
 
 
238 aa  54.7  0.0000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  33.72 
 
 
233 aa  54.3  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  30.43 
 
 
244 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  34.52 
 
 
245 aa  53.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0937  protein of unknown function DUF45  48.98 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  29.35 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  31.68 
 
 
243 aa  53.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  36.23 
 
 
224 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  46.94 
 
 
240 aa  52.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  23.96 
 
 
215 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  38.98 
 
 
240 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  35.16 
 
 
226 aa  52  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  30.23 
 
 
245 aa  52  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  31.18 
 
 
223 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  34.88 
 
 
239 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  31.94 
 
 
237 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  33.73 
 
 
261 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  35.62 
 
 
221 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  40.68 
 
 
240 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  38.24 
 
 
234 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  30.14 
 
 
238 aa  51.2  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
202 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  37.5 
 
 
243 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  33.68 
 
 
227 aa  51.2  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  40 
 
 
184 aa  50.8  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 
262 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  47.92 
 
 
249 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  27.84 
 
 
242 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  33.82 
 
 
301 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  37.84 
 
 
268 aa  50.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  29.59 
 
 
244 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  34.33 
 
 
292 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  33.82 
 
 
286 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  34.33 
 
 
292 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  33.82 
 
 
316 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  32.05 
 
 
249 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  34.33 
 
 
295 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  36.36 
 
 
270 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  34.33 
 
 
300 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  34.33 
 
 
300 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  34.33 
 
 
295 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  34.33 
 
 
295 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  34.33 
 
 
292 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0609  hypothetical protein  29.41 
 
 
179 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  34.33 
 
 
292 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  34.33 
 
 
292 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  34.33 
 
 
292 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  34.33 
 
 
292 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  34.85 
 
 
252 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  30.59 
 
 
198 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  31.4 
 
 
253 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  34.33 
 
 
295 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  30.3 
 
 
219 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  35.29 
 
 
285 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1624  hypothetical protein  34.38 
 
 
187 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.594523  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  34.33 
 
 
303 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  31.03 
 
 
227 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  34.15 
 
 
243 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  34.62 
 
 
238 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>