38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0126 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0126  zinc finger CDGSH-type domain protein  100 
 
 
77 aa  161  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000192409  decreased coverage  0.000678625 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0138  zinc finger CDGSH-type domain protein  78.67 
 
 
76 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2662  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  60.81 
 
 
74 aa  91.3  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00723724  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0104  zinc finger CDGSH-type domain protein  56.52 
 
 
74 aa  90.1  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0099  Zn-finger, CDGSH type  57.75 
 
 
77 aa  83.6  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.15953  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0916  zinc finger CDGSH-type domain protein  44.29 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1481  zinc finger CDGSH-type domain protein  46.38 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000532674 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0862  hypothetical protein  46.88 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0041853  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1697  Zn-finger, CDGSH type  47.69 
 
 
93 aa  67  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.214083  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.71 
 
 
510 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3910  zinc finger CDGSH-type domain protein  43.06 
 
 
82 aa  63.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1927  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.86 
 
 
82 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138644  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0430  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  46.43 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  37.93 
 
 
518 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.58 
 
 
516 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.94 
 
 
502 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.58 
 
 
516 aa  57.4  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.68 
 
 
516 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  40.74 
 
 
515 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1719  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  37.68 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.703607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3396  Zinc finger, CDGSH-type  38.89 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1679  zinc finger CDGSH-type domain protein  37.18 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0957  zinc finger CDGSH-type domain protein  42.86 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.446917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2606  hypothetical protein  42.86 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223152 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1219  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  41.82 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.273189  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1168  zinc finger CDGSH-type domain protein  37.5 
 
 
77 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000181861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.29 
 
 
514 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4778  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 
350 aa  53.9  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2171  hypothetical protein  36.23 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00528546  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1000  Zinc finger, CDGSH-type  41.1 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3093  zinc finger CDGSH-type domain protein  37.5 
 
 
76 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193762  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0808  hypothetical protein  39.62 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0266  zinc finger CDGSH-type domain-containing protein  52.94 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00519486  normal  0.318668 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0779  hypothetical protein  37.04 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  41.51 
 
 
214 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1986  zinc finger CDGSH-type domain protein  48.48 
 
 
90 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  57.14 
 
 
594 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0865  protein of unknown function DUF1271  70.83 
 
 
219 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>